草丁膦乙酰转移酶基因序列分析
2021-12-17刘倩琪王学林
农村科学实验 2021年34期
刘倩琪 王学林
(广东省深圳市农业科技促进中心,广东 深圳 518000)
bar基因来源于土壤吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus),具有良好的抗草丁膦除草剂的性能,多用作转基因植物的选择标记。据国际农业生物技术应用服务组织(ISAAA)公布,油菜、棉花、菊苣、玉米、水稻、大豆等6种植物58个品系以bar作为筛选标记基因。
我国在转基因植物研发、选育、鉴定过程中,常把bar基因作为转基因成分检测的重要靶标元件。
研发机构因研究材料差异而选择不同的bar基因或者改造bar基因作为分子标记,国标、行标中bar基因则规定检测175 bp和262 bp两个片段,显然无法满足bar基因多样性的要求;检测出与目的片段大小不一致的特异性电泳条带,按照标准判定为阴性,可能会造成漏检;普通的凝胶电泳分辨率较低,亦无法判断待测样外源基因序列是否与标准提供的序列一致,从而导致目的片段差异较小或序列内部存在差异时,难以判定。
本文针对检测工作中发现的水稻和小麦两个待测样中与目标序列不同的特异性bar基因片段,采用PCR产物测序法进行序列比对分析,发现水稻和小麦待测样品的bar基因尽管上下游引物序列相同,内部基因序列差异较大,相似度低,说明测序技术能够更精准地判定待测样阴阳性,该研究转基因成分检测及其标准修订具有重要的参考意义。
1.材料与方法
1.1 材料
水稻种子由上级主管部门的市场监督抽查任务所获得,小麦样品为某品牌在售干面条;标准对照样品为检测bar基因的MS1。……
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