生态文明建设研究中心研究领域包括生态文明示范区创建、绿色低碳和高质量发展、生态修复与污染协同治理等，下设4个研究室和1个创新团队。

(一)生态文明建设与规划研究室。主要从事生态文明建设规划、生态环境保护规划、生态工业园区规划、产业园区规划环评编制工作。开展生态文明建设基础理论、技术方法和管理制度研究，研发生态文明建设效果评估技术方法。

(二)绿色发展技术与模式研究室。研究区域绿色转型与高质量发展、创新驱动发展的评价方法、产业结构调整及优化技术。研发典型废弃物处理处置和高值化利用、多功能生物质炭基材料转化、碳捕捉利用与封存等绿色适用技术。研究基于“绿水青山就是金山银山”理念的可持续生态循环农业技术与模式。

(三)生态文明评估与环境经济研究室。承担国家生态文明建设示范区、国家环境保护模范城市、“绿水青山就是金山银山”实践创新基地等生态示范创建指标体系、评价方法与监管政策研究。研发快速城市化地区和欠发达地区以产业生态化和生态产业化为主体的生态经济体系一体化构建技术，阐释生态保护与污染治理的环境经济学基础。

(四)生态工业与循环经济研究室。研究生态工业示范园区等重点区域的绿色低碳与高质量发展评价方法、产业结构调整与优化技术等，建立产业生态化和生态产业化的适用技术、污染防治、发展模式、政策与措施，研究资源开发利用、环境质量控制与产业生态化的管控标准、政策和法规。……