CPT1A基因外显子纯合缺失变异导致的肉碱棕榈酰转移酶1A缺乏症1例
2021-12-11张志华周霄颖郑必霞
张志华,王 兰,周霄颖,郑必霞,林 谦*
1南京医科大学附属儿童医院消化科,2儿科学重点实验室,江苏 南京 210029
肉碱棕榈酰转移酶1A(carnitine palmitoyltrans⁃ferase 1A,CPT1A)缺乏症(OMIM#255120)是一种长链脂肪酸氧化障碍的常染色体隐性遗传疾病,由CPT1A 基因(OMIM#600528)变异导致。CPT1A 是长链脂肪酸进入线粒体进行β氧化的限速酶。当CPT1A缺乏症患者长期禁食或处于病理状态时,糖原贮备不足,肝脏线粒体脂肪酸β氧化提供能量被抑制,出现低血糖、肝性脑病等多系统症状[1]。该疾病罕见,到目前为止,人类基因组突变数据库(Human Genome Mutation Database,HGMD)仅收录了41种突变(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/gene.php?gene=CPT1A),多为点突变,本文首次报道了中国人群中1例外显子4~5纯合缺失的变异类型,丰富了该基因变异谱,并结合qPCR进行了验证。
1 病例资料
患儿,男,2岁10个月。因“肝功能异常3周”入院。患儿3 周前因“低血糖晕厥”于当地医院治疗,查丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase,ALT)173.0 U/L,予美能、谷胱甘肽保肝治疗3周,复查肝功能,ALT 250 U/L,遂来就诊。入院查体:肝脏右肋下3 cm,质中。余查体无异常。父母体健,否认家族史。入院诊断:肝功能损害。
基因测序:采集患儿及其父母静脉血3 mL(EDTA 抗凝)送至北京全谱医学检验实验室,进行全外显子组测序,外周血标本DNA 抽提前,患儿监护人填写知情同意书,本研究获南京儿童医院医学伦理委员会批准。本实验将正常对照样本与先证者及父母样本进行同组荧光定量PCR检测,以ALB基因为内参基因,对目标基因CPT1A 的4~5 外显子的拷贝数进行相对定量检测(用荧光定量PCR法)。计算公式为2-ΔΔCt。qPCR所用引物序列见表1。

表1 CPT1A基因外显子4~5 qPCR扩增引物设计
入院……