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靶向肿瘤因子c-MYC基因启动区G4-DNA的小分子药物设计及核磁共振研究进展

2021-12-10胡晓东蓝文贤王春喜曹春阳

波谱学杂志 2021年4期
关键词:结构

胡晓东,蓝文贤,王春喜,曹春阳

靶向肿瘤因子c-基因启动区G4-DNA的小分子药物设计及核磁共振研究进展

胡晓东,蓝文贤,王春喜,曹春阳*

中国科学院分子合成卓越中心,中国科学院上海有机化学研究所生命有机国家重点实验室,上海 200032

肿瘤基因在人类70%癌细胞中高表达,抑制其转录是治疗肿瘤的有效手段.c-启动子区P1近端的核酸酶超敏元件III1(NHE III1)控制基因近90%的转录激活.NHE III1区域富含碱基G序列并且形成G-四链体(G4),调控c-基因转录,是抗肿瘤药物靶标.但G4-DNA和G4-RNA的三维结构高度相似,小分子与其他G4(如端粒G4、mRNA G4、c-G4等)的非特异性作用会产生小分子药物“脱靶”效应,同时小分子药物会诱导其他G4形成从而干扰正常细胞的功能,造成靶向c-G4抗癌药物设计困难.本文综述了近些年靶向肿瘤因子c-G4-DNA的小分子药物研究进展,及核磁共振(NMR)技术在G4-DNA和G4-RNA结构确定中的作用,为靶向c-G4-DNA的小分子药物设计等相关研究工作提供参考.

肿瘤基因;c-;G-四链体(G4);小分子药物;核磁共振(NMR)

引 言

脱氧核糖核酸(DNA)是重要的遗传物质,不仅可以形成规整的B型双螺旋结构,还可以形成十余种不规整的非B型DNA结构,如Z-DNA、DNA错配、三螺旋(triplex)、四螺旋(quadruplex)、发卡式结构等[1].G-四链体(G4)是由Gellert等[2]于1962年发现的一种不规整的核酸二级结构,主要由富含鸟嘌呤(G)的DNA或RNA序列在一价阳离子(K+、Na+或NH4+等)的作用下,通过Hoogsteen氢键形成G-四集体(G-tetrad)(图1),并进一步堆积而成.

图1 G-四链体结构组成.(a) G-四集体通过Hoogsteen氢键形成;(b) G-四链体结构中心被一价阳离子稳定

G-四链体结构形式多样,包括:(1)链排列方向多样性.四条链有三种组合方式:四条链都平行、三条链平行与另一条链反平行、两条链平行与另外两条反平行[图2(a)];……

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