1株重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及序列分析
2021-12-07董建国何书海焦凤超赵攀登
董建国 , 饶 丹 , 刘 涛 , 胡 静 , 何书海 , 焦凤超 , 陈 斌 , 黄 立 , 赵攀登
(1. 信阳农林学院牧医工程学院 , 河南 信阳 464000 ; 2. 河南牧业经济学院动物医学院 , 河南 郑州 450046)
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是一种对养猪业危害严重的传染病,该病的病原是猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)。PRRSV的基因型分为两类(I型、II型),在欧洲流行的以Lelystad virus (LV)为代表的毒株归为I型 ; 在北美流行的以VR-2332为代表的毒株归为II型,这2种毒株之间全基因组同源性仅为60%,抗原性也有很大差异[1-2]。我国首先分离到的PRRSV毒株为CH-1a[3],2006年高致病性毒株在我国暴发,造成了严重的经济损失[4]。近年来又流行了NADC30-like毒株。由于PRRSV的毒株较多、变异性强等特性,给该病的防控带来严峻的挑战,因此掌握PRRSV的遗传演化规律对防控PRRS十分关键。为了进一步了解广东地区PRRSV流行毒株的遗传特性,本试验在该地区分离到了PRRSV毒株,并对其全基因组进行了测序分析,掌握了该毒株的遗传演化特性,为广东地区PRRSV的防控提供数据支持。
1 材料与方法
1.1 病料与主要试剂 样品采自广东省某疑似暴发PRRS的猪场,采集发病猪的肺部病变组织,置于-80 ℃ 备用。Marc-145 细胞为本试验室保存;病毒DNA/RNA 提取试剂盒、Trans-5α感受态细胞、RT-PCR 相关试剂盒、胶回收试剂盒和DL2 000 DNA marker,均购自宝生物工程(大连)有限公司。
1.2 引物设计与合成 根据GenBank中收录的PRRSV代表毒株全基因组序列,设计出1对扩增GP5基因的鉴定引物(GP5F:5′-GTGTCAGGCATTGTGGCTGTG-3′;GP5R:5′-CATTATTGGCATGTAGGTGATAGAAAA-3′)和13对特异性引物用于扩增全基因组序列,引物由金维智有限公司合成。引物信息见表1。

表1 PRRSV全基因组扩增引物Table 1 Amplification primers of PRRSV whole genome
1.3 病料处理 将采集的病变组织剪碎,混合1 mL 的PBS在4 ℃环境下充分研磨,组织研磨液,10 000 r/min 离心10 min,收集上清液,用0.22 μm微孔滤器过滤除菌,得到的滤液置于-20 ℃保存。……
