顾 鹏，孙 星

上海交通大学附属第一人民医院普外科，上海 201620

基因表达程序异常会导致癌细胞持续增殖、复制永生化、逃避凋亡及转移等［1］，由遗传学和表观遗传学改变驱动的转录失调是癌症的重要发生机制［2-3］。决定癌细胞状态的转录激活程序受细胞类型特异的近端调控元件启动子和远端调控元件增强子的控制。

1981年，Benoist等［4］在猿猴空泡病毒早期基因的5'端上游发现了首个增强子，由72 bp的重复序列构成，插入该序列的载体能使HeLa细胞中兔β球蛋白基因的表达量增加200多倍［5］。与启动子不同，增强子调控基因转录的模式不具有方向性，且不受距离限制［6］。增强子区域通过与启动子区域的直接相互作用形成三维环状结构［7］，激活远处的基因转录。有研究［8］发现，单个增强子甚至能调控多个基因的表达。

除普通增强子（typical enhancers，TEs）外，基因组上还存在大段紧密相连的增强子，即超级增强子（superenhancers，SEs）。2013年，研究［9］发现小鼠胚胎干细胞的关键转录因子，如OCT4、SOX2和NANOG结合在一些特殊的增强子上，后者对于维持胚胎干细胞的干性十分重要，由此将其定义为SEs。同年，Whyte等［9］用关键转录因子PU.1、MyoD等进行染色质免疫共沉淀测序（chromatin immunoprecipitation sequence，ChIP-Seq）分析，在多种小鼠细胞中鉴定出了SEs。本文阐述SEs的基本结构与功能特征、相分离凝集体的形成，重点分析SEs驱动致癌转录的机制及拓扑相关结构域的形成及意义。

1 SEs的基本结构与功能

SEs是具有转录活性的增强子的一个大簇。在长度上，SEs横 跨DNA的 长 度 比TEs高 一 个 数 量 级［9］。ENCODE（encyclopedia of DNA elements）数据库［10］中，SEs长度的中位数一般介于10～60 kb，而TEs为1～4 kb。……