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谷子ZF⁃HD 基因家族的鉴定及生物信息学分析

2021-12-01李珊刘永琪朱垠豪葛星辰段明韩渊怀马芳芳

山西农业大学学报(自然科学版) 2021年5期
关键词:水稻分析

李珊,刘永琪,朱垠豪,葛星辰,段明,韩渊怀,3,马芳芳,3*

(1. 山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801;2. 山西农业大学 实验教学中心,山西 太谷 030801;3. 杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室,山西 太谷 030801)

谷子(Setaria italica(L.)Beauv.)为禾本科狗尾草属的一种重要的杂粮作物,在距今6 000~7 000 年前的新石器时代中早期完成驯化,成为农耕文化的主栽作物,广泛种植于亚洲与欧洲温带和热带地区。中国是谷子的原产地,主要栽培在北方的干旱半干旱地区和盐碱地地区,常年的播种面积约133. 3 万hm2左右[1]。谷子对干旱及其他不良环境的耐受性和适应性较强,同时小米富含蛋白质、矿质营养元素、维生素、类胡萝卜素、叶酸等营养物质且不含麸质,对于患有动脉硬化、糖尿病和心脏病的人来说是很好的饮食选择[2,3]。转录因子(transcription factor,TF),也被称为反式作用因子。现如今抗逆基因的转录调控在植物响应逆境胁迫的研究报道已经非常普遍,转录因子可以单独或者与其他转录因子协同作用于逆境响应靶基因启动子区域中的启动子元件,与之结合从而激活或者抑制这些基因的转录,进而提高植物对逆境胁迫的耐性与抗性,促进植物在生长发育、形态建成过程中逐渐形成抵抗逆境的各种应答体系[4]。

ZF-HD(Zinc Finger Homeodomain)转录因子是植物特有的转录因子,它的显著特征是包含一个锌指结构域(zinc fingre,ZF)和一个同源异形盒结构域(homeodomain,HD),也是由此命名。生物体中都存在同源异形基因,参与调节它们的生长发育、形态建成以及对逆境的抗性和耐受性,最早于1984 年在果蝇中发现[5]。……

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