邢 钰 冯慧喆

（1.西南林业大学林学院，云南 昆明 650224；2.枣庄学院，山东 枣庄 277160）

1 传统物种分类学与基因组学系统发育的研究

研究物种的进化关系不仅可以为分类学提供理论依据和发展方向，还可以通过揭示物种之间亲缘关系的远近和进化关系，从而精确地估计物种的进化地位，进而更好地理解和保护生物的多样性。传统物种分类学的研究主要是基于对物种各部分形态的比较分析，如植物的分类学中对根、茎、叶、花、果实、种子等形态的观察判断。现如今，通过分子系统发育分析结果的检验，证明了传统物种分类学的很多结论都是错误的［1］。但是，由于形态学分析在野外采集初期中非常重要，且分子方面的分析研究耗时较长，所以传统物种分类学仍不能被摒弃，并且将其与分子分析相结合，将会极大地提高物种系统发育学研究的准确性。以往对植物系统发育学研究的研究主要集中在核型分类学分析、花粉形态分析、叶柄和果实解剖学分析等，而目前对进化关系的研究，主要是结合形态学特性的分析结果与分子系统发育的关系，且后者的分析仅基于DNA序列的系统发育分析，特别是基于核基因组内核糖体DNA的内部转录间隔（ITS）区域。

2 核基因与质体基因的差异与分析

真核细胞的细胞质基因是存在于一些细胞器中的DNA分子，这些基因只能在细胞器（如叶绿体、线粒体）的内部完成表达并控制某些性状，而且子代细胞的细胞器全部来自母本（受精时，由于精子中的细胞质极少，所以可以认为受精卵中的细胞质全部来自母本）。……