病毒宏基因组学在新发病毒快速确认中的优势
2021-11-29张文代紫苑鲍思雯茅庆庆
江苏大学学报(医学版) 2021年1期
关键词:检测
张文,代紫苑,鲍思雯,茅庆庆
(江苏大学医学院,江苏 镇江 212013)
自然界中存在着数量庞大的未知新型病毒种类,而人类认知的病毒只占所有潜在病毒类型的0.1%[1],这些潜在的未知新型病毒极易造成新发病毒感染性疾病。研究人员经过实地调查研究结合统计学方法,认为哺乳动物体内尚未发现的未知病毒有近百万种[1-2]。传染病专家预计在未来相当长一段时间内,人类新发传染病的病原体将主要来自动物体携带的未知新型病毒[3]。随着科学技术、工农业和交通工具的快速发展,人类和资源的流通及人类接触自然领域的速度和频率迅速提高,这导致新发传染病的发生案例逐年增多。近30年来全球出现的新发传染病达100多种,并以每年新发2~3种的态势发展,对人类健康危害巨大,已经成为全球公共卫生领域关注的焦点[4]。从近年来新发或再发的传染病案例来看,其病原体多为病毒,如2020年全球爆发感染的SARS-CoV-2[5-6],频繁爆发的新型禽流感病毒(avain influenza virus)[7]、中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)[8]、寨卡病毒(Zika virus)[9]等。此外,临床上尚有一些不明病因急性或慢性感染性疾病,给特异性诊疗带来巨大困难。如临床急性或慢性胃肠道疾病中有近40%的病例无法查出病因[10-11],有10%~20%的急性肝炎及30%的隐发性慢性肝病的病原体尚不明确[12-14];其中有些临床不明病因的感染性疾病已经被证实与新发病毒的感染有关[15-17]。新发病毒的感染具有不可预知性且不易被传统方法检出,对此人类还没有有效的早期防治措施。……
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