孙雨露，管忆楠，姚永忠

(1.南京大学医学院附属鼓楼医院 普外科，江苏 南京 210008; 2.东南大学 医学院，江苏 南京 210009)

世界卫生组织国际癌症研究机构(International Agency for Research on Cancer, IARC)2020年最新统计显示，女性乳腺癌现已超过肺癌，成为全球第一大癌种[1]。许多基因组或转录组研究已经揭示了乳腺癌转移以及预后不良的遗传特征[2- 4]。但是人类乳腺癌组织中蛋白质组和转录组数据并不完全一致，这体现了对疾病调控基因进行蛋白水平测量的价值，毕竟蛋白质才是细胞中真正的效应分子[5]。近年来，通过基于质谱(mass spectrometry，MS)法的高通量和高精度蛋白质组学技术，可以揭示乳腺癌发生发展的机制，筛选乳腺癌相关的肿瘤标志物和分子靶点，蛋白质组学已逐渐成为乳腺癌早期诊断、治疗及预后评估的有效方法。作者对近年来蛋白质组学在乳腺癌研究中取得的进展作一综述。

1 蛋白质组学

组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学)方法论可以帮助我们更全面更细致地认识复杂的生物系统，被广泛应用于生物医学领域。蛋白质组学是在基因组学和转录组学的基础上迅速发展的新兴学科，它旨在研究蛋白质在任何阶段的表达、结构、功能、相互作用和修饰，可以通过结合生物信息学工具来阐述涉及复杂疾病的生化过程和发展规律，对疾病的早期诊断、治疗、预后判断有指导作用[6- 7]。

最初，酶联免疫吸附测定(enzyme- linked immunosorbent assay, ELISA)和蛋白质印迹只能被用于特定蛋白质的分析，而十二烷基硫酸……