钟爱华 代小新

黄颡鱼()成体造血器官头肾和体肾转录组比较研究*

钟爱华 代小新

(浙江海洋大学水产学院 舟山 316022)

硬骨鱼类具有独特的免疫系统, 其头肾和体肾是重要的造血和免疫器官。为探索黄颡鱼头肾和体肾造血和免疫功能异同, 采用Illumina HiSeq NovaSeq 6000测序平台对黄颡鱼头肾和体肾进行了转录组高通量测序; 测序序列经质控、组装后, 共获得59 979个转录本(transcript), N50为3 919 bp; 获得的转录本在NR、GO、KEGG、Swiss-Prot和Pfam数据库中比对和注释, 共有24 487个Unigenes获注释。差异表达基因分析显示, 1 112个基因在头肾中上调, 包括KIT配体、早期B细胞因子1、Toll样受体1和2等免疫相关基因; 2 737个基因在体肾中上调, 如C-C趋化因子19和25、补体5和9、白细胞介素17受体C、RIG-I和白细胞介素27等免疫相关基因, 部分抗体重链可变区编码基因和抗体轻链κ链可变区编码基因仅在体肾中表达。结果表明, 黄颡鱼头肾和体肾中免疫相关基因表达具有差异性, 两者造血和免疫功能具有组织特异性。研究结果有助于黄颡鱼头肾和体肾造血和免疫功能研究, 可为黄颡鱼病害防治提供基础资料。

黄颡鱼; 头肾; 体肾; 转录组测序

硬骨鱼类免疫系统与哺乳动物不同, 硬骨鱼类骨髓没有造血功能, 取而代之的是头肾和体肾, 成体时头肾一般不具有肾小管, 因而没有排泄功能; 而体肾既有排泄功能又有造血功能。作为重要的中枢免疫器官, 头肾和体肾不仅能支持造血细胞分化、发育、成熟, 维持血细胞相对稳态, 还参与机体免疫防御反应, 以阻止和清除入侵病原体及其毒素(Zwollo, 2005)。……