基于SSR扩增与测序分析的主栽烤烟品种遗传多样性研究
2021-11-15田阳阳轩贝贝王正旭郭建华牟文君戴华鑫杨继周宋纪真胡利伟
田阳阳,轩贝贝,王正旭,刘 魁,郭建华,牟文君,戴华鑫,杨继周,宋纪真,胡利伟*
(1.红塔烟草(集团)有限责任公司,云南 玉溪 653100;2.中国烟草总公司 郑州烟草研究院,河南 郑州 450001)
我国烟草种质资源丰富,至2018年,我国全国烟草品种审定委员会共审(认、鉴)定了145个烟草新品种,其中审(认、鉴)定的烤烟品种达82个[1]。 目前我国烤烟种植主要集中于西南、华南、华北、东北等地区,主要植烟省份有云南、河南、贵州、山东等18个省(市、区)[2-4]。经过多年的发展,我国烟叶生产逐渐趋于稳定,并形成了相对稳定的烟叶产供格局。近3年,种植面积较大的烤烟品种主要有云烟87、K326、红花大金元、云烟85、云烟97、中烟100等[5,6]。主栽烤烟品种的亲本比较集中,亲缘关系较近,如云烟87与云烟85为姊妹系,亲本相同,均是以K326和云烟2号为亲本杂交选育出来的;云烟97和云烟99的母本均为云烟85;云烟100的母本为云烟87,其形态学特征差异不明显。多数研究表明我国烤烟遗传背景狭窄,遗传多样性较低,利用传统手段对烤后烟叶进行品种鉴定存在一定的难度[7]。
SSR荧光标记检测技术是直接将荧光染料标记到SSR引物的5’端或引物内部的某个碱基上,然后进行PCR扩增,使每一个扩增产物都带有荧光染料,荧光标记DNA片段在通过毛细管正极受到激光扫描时发射出特定波长的荧光,扫描仪获取荧光强度,同时记录激发时间,通过出峰时间计算出DNA片段大小,根据峰值高度计算出PCR产物的量[8-10]。 该检测体系可以一次检测多个不同PCR扩增产物,根据PCR产物携带的荧光颜色的不同分离出不同SSR位点的PCR产物[10,11]。……
