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猪lncRNA TCONS-00035174基因全长克隆及组织表达

2021-11-09赵延辉盛熙晖齐晓龙曹永春崔德凤张永红倪和民王楚端

北京农学院学报 2021年4期

赵延辉,邢 凯*,盛熙晖,齐晓龙,曹永春,崔德凤,张永红,倪和民,郭 勇,王楚端*

(1.北京农学院 动物科学技术学院,北京 102206;2.中国农业大学 动物科学技术学院,北京 100193)

长链非编码RNA(lncRNA)是非编码RNA重要的组成部分,其蛋白质编码能力很弱甚至不存在。研究表明,基因表达受到lncRNA的调控,在细胞生长及肿瘤的生成方面起着不可替代的作用[1]。随着下一代测序(NGS)技术的应用,lncRNA对肌肉生长和脂肪沉积的调控作用陆续被发现[2-4]。XING等[5]以阉割和正常淮南公猪为试验对象,并选取背最长肌进行转录组分析,结果显示了8 946个lncRNA的表达受到阉割的影响,其中有385个lncRNA及其靶基因可能与骨骼、肌肉发育相关。ATKINSON等[6]通过比较脂肪型猪陆川猪和瘦肉型猪杜洛克猪脂肪组织的转录组,共检测到503个差异表达的lncRNA,其中部分lncRNA可能参与了脂肪细胞因子的调控过程。HUANG等[7]对莱芜猪和大白猪皮下脂肪组织的转录组进行了研究,检测到54个差异表达的lncRNA,其中有6个关键lncRNA及其靶基因可能发挥调控脂肪沉积的作用。MIAO等[8]对金华猪和长白猪两者之间的脂肪组织中的lncRNA进行了鉴定,共发现了119个差异表达的lncRNA,同时发现有6个lncRNA参与相关脂肪代谢途径,包括脂肪沉积和脂肪代谢。

松辽黑猪和长白猪在肉品质方面差异明显[9]。课题组前期利用高通量测序技术获得松辽黑猪和长白猪背最长肌中差异表达的lncRNA TCONS-00035174基因[10],为对其进行深入研究,本试验对lncRNA TCONS-00035174基因进行全长克隆并进行分子特征分析和不同组织中表达量的比较,为以后松辽黑猪和长白猪肉品质差异研究提供有用信息。……

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