李春晖, 何程实, 吴建鑫, 韦张其, 杨少华, 刘国庆

(合肥工业大学 食品与生物工程学院,安徽 合肥 230601)

0 引 言

鸡胚在孵化过程中是以半封闭形式进行,其代谢产物只能依靠自身进行分解,如在生长发育过程中呼吸作用产生的自由基。鸡胚在发育过程中需要大量的氧气提供能量以维持机体的快速代谢等生命活动,从而导致产生更多的活性氧,而高水平的活性氧会造成蛋白质、脂质过氧化以及 DNA损伤[1]。因此存在于鸡胚内部的超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化酶(GSH-Px)、过氧化物酶(POD)等酶发挥作用清除活性氧,以保证发育过程中的氧化应激平衡。已有研究表明,在鸡胚的发育过程中,不同组织中的相应抗氧化酶是不断变化的[2-4],其中肝脏组织是鸡胚中发挥抗氧化作用最显著的器官。然而关于这些抗氧化相关的mRNAs研究却报道不多,因此基于转录组测序技术筛选抗氧化相关的mRNAs并对其进行功能分析具有重要的研究意义。

近年来,随着新一代转录组测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)技术逐渐成为大规模研究转录组的一种新的且更为有效的方法[5]。RNA-seq技术是利用大规模测序技术直接对cDNA序列进行测序,产生数以千万计的测序序列数量,从而使得一段特殊的基因组区域的转录水平可以直接通过比对到该基因组区域的测序序列数量来衡量[6]。文献[7]研究表明不同发育时期牛胚胎的转录本与牛的基因组对比后发现了1 785个新的转录本;文献[8]研究表明禽……