2008年-2015年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株遗传进化分析
2021-11-02顾小雪宋晓晖王传彬吴佳俊刘金华
张 硕，张 倩，顾小雪，徐 琦，宋晓晖，王传彬，吴佳俊*，刘金华，周 智*
(1.中国农业大学 农业部动物流行病学与人畜共患病重点实验室，北京 100125；2.中国动物疫病预防控制中心 国家/OIE猪繁殖与呼吸综合征参考实验室，北京 102618)
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome，PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV)引起的一种危害全球养猪业的病毒性传染病。PRRSV是有囊膜单股正链RNA病毒，全长约15 kb，含有10个开放阅读框(open reading frames,ORFs)，ORF1a和ORF1b编码病毒的12个非结构蛋白，ORF2a，ORF2b，ORF3～7编码病毒的8个结构蛋白[1-3]。
PRRSV有美洲型和欧洲型2个基因型，各基因型又分为许多基因亚型。其在中国猪群中存在多种类型的PRRSV混合感染，进而导致中国PRRS流行状况十分复杂[1-3]。此外，PRRSV又是变异和演化速度极高的一种RNA病毒，尤其是2015年以后类NADC30毒株在我国猪群中成为主要流行毒株[4-5]，其持续变异与演化和毒株的多样性加剧了PRRS预防与控制的难度。那么在类NADC30毒株流行之前，我国猪群中猪PRRSV的流行变异与演化是否就已经出现了加速，为了了解中国2015年以前 PRRSV 的流行变异情况，明晰流行毒株种类、特点及毒株间的遗传演化关系，对本实验室2008年-2015年在我国分离的56株PRRSV的全基因序列进行了测定，绘制了进化树并分析了主要易变区域Nsp2、GP5和非编码区的遗传变异情况。结果显示2008年-2015年中国猪群中的PRRSV主要流行毒株是美洲型高致病性PRRSV变异株，一直到2015年猪群中才出现了美洲型类NADC30 PRRSV 的流行，并成为近年的流行毒株，研究结果对于了解我国PRRSV的流行趋势和防控措施具有重要意义。
