基于线粒体控制区序列的黄海日本鳀(Engraulis japonicus)的群体遗传结构*
2021-11-02邹聪聪王丽娟吴志昊尤锋
邹聪聪, 王丽娟, 吴志昊, 尤锋
1. 中国科学院实验海洋生物学重点实验室, 海洋大科学中心(中国科学院海洋研究所), 山东 青岛 266071;
2. 青岛海洋科学与技术试点国家实验室实验海洋生物学与生物技术实验室, 山东 青岛 266237;
3. 中国科学院大学, 北京 100049
遗传多样性是影响种群适应能力的关键因素,尤其是在多变和极端环境下(Ketchum et al, 2016),而群体结构则反映了种群在进化过程中因地理或生态变化等所产生的环境适应性分化(高天翔 等,2020)。它们是研究种群动态变化的基础, 也是生物分子系统地理学研究的重要内容, 能为可持续渔业的开发、物种管理和保护提供重要建议(Montes et al,2017)。因此, 为了解海洋生物遗传多样性的现状、系统地理结构和物种进化过程, 许多海洋生物开展了生物分子系统地理学研究。借助分子标记, 研究鱼类群体遗传变异和多样性可以有效地了解目前该鱼种的资源状况和追溯群体的历史变化(Menezes et al, 2012; Zhang et al, 2014)。线粒体DNA具有母系遗传、进化速度快等特点, 已被广泛应用于群体遗传、历史动态分析研究(Guo et al, 2014; Munian et al,2015)。其中, 线粒体控制区是一段非编码基因序列,由高变位点组成, 因其受自然选择压力小, 突变率高, 被广泛应用于群体遗传变异分析(Han et al,2008; Myoung et al, 2014)。
日本鳀(Engraulis japonicus)隶属于鲱形目(Clupeiformes)、鳀科(Engraulidae), 是一种小型远洋型的群居鱼种, 广泛分布于西北太平洋的沿岸(Ohata et al, 2018)。在中国其主要分布在渤海、黄海和东海, 是黄海和东海单种鱼类资源生物量最大的鱼种之一(朱琨 等, 2020)。日本鳀属暖水性中上层鱼类, 主要以浮游生物为食, 其在幼虫阶段被称为“海蜒”, 是海洋食肉动物的主要猎食对象, 如海洋哺乳动物和海鸟等(Checkley et al, 2017)。……
