基于分子对接虚拟筛选PBP2a蛋白蒲公英活性成分抗菌剂
2021-10-26吕小刚梁引库穆阿宁
陕西理工大学学报(自然科学版) 2021年5期
刘 旭, 吕小刚, 梁引库,2*, 穆阿宁
(1.陕西理工大学 生物科学与工程学院, 陕西 汉中 723000; 2.陕西省资源生物重点实验室, 陕西 汉中 723000)
青霉素结合蛋白(PBPs)在细菌细胞壁的形成过程中起着关键作用。β-内酰胺类抗生素可以结合PBPs,从而影响细胞壁肽聚糖的生物合成,起到杀菌作用。其作用机制为抗生素与PBPs可形成共价酰基酶复合物,它抑制了细胞壁转肽而使脱酰化反应受阻来杀死细菌[1]。但耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin resistant Staphylococcus aureus,MRSA)作为典型的耐药菌,其产生的PBP2a作为一种较为特殊的青霉素结合蛋白,与抗生素亲和力很低从而导致广谱耐药一直威胁着人类的安全[2]。作为治疗MRSA感染的有效药物万古霉素及相对新型药物利奈唑胺和达托霉素已经不足以满足当前需求,开发一种新型抗耐药类药物迫在眉睫。而中药具有广谱抗菌作用,表现出多组分多途径的作用功效,是现今逐渐被认可的有效抗菌药物。从中药中寻找一种或几种天然活性物质直接作用于细菌表面或协同抗生素增加MRSA对药物敏感性为近年来的研究热点。由于传统实验筛选新药周期长,为减少药物筛选的盲目性,提高研发效率,采用分子对接技术虚拟筛选得到与靶蛋白紧密结合的候选化合物,从而提高新药研究的成功率。谷宇等[3]利用分子对接技术靶向筛选大黄、羌活和秦艽几味中药抗炎活性成分,得到了12个天然抗炎活性抑制剂;周月等[4]同样利用分子对接技术筛选出了23个打分高于阳性药物的菊苣活性成分。……
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