纳米孔测序技术鉴定陕西省首例马尔尼菲青霉菌感染病例
2021-10-21刘东立毛凌峰王益群王安礼
马 琳,刘东立,毛凌峰,王益群,丁 龙, 王安礼
马尔尼菲青霉菌(Penicilliummarneffei,PM)是300余种青霉菌中唯一致病的双相型真菌[1],在自然界寄生于竹鼠[2],一般认为可污染环境通过气溶胶感染人类。PM可引起马尔尼菲青霉菌感染病(Penicilliosis marneffei,PSM),常见于免疫抑制人群,是艾滋病常见的机会性感染性疾病之一。PSM流行于东南亚国家地区[3]及中国广东、广西、香港、台湾等省区[4],近年国内外艾滋病疫情上升蔓延,旅游、商务等交流日益频繁,内陆省份也有输入性感染的报道[5]。宏基因组分析技术是对患者标本所含核酸进行高通量测序,通过生物信息学分析,与病原菌数据库查询比对,可获得可能感染的病原体信息[6],节省了病原培养时间,并可对未知病原及无法培养的病原进行鉴定。纳米孔测序技术是近年来发展的第三代测序技术,MinION纳米孔测序仪小巧便携,具有建库迅速、超长读长、实时获取数据、实时分析等优点,在感染性疾病现场快速鉴定病原具有独特的优势[7]。2019年12月,本实验室利用纳米孔测序、分子诊断及双相培养确诊1例PSM的患者,为中国陕西省首次发现该病。本文就该病例的发现与病原学鉴定进行探讨。
1 材料与方法
1.1 临床资料 患者男性,33岁,中国陕西省汉中市人,常居西安市,职业为导游,经常带团去东南亚国家。于2019年11月初无明显诱因出现乏力、盗汗,无发热、咳嗽、腹胀、腹泻等不适,于当地诊所口服中药治疗10 d,效果不佳。11月19日就诊于陕西省汉中市中心医院,血常规检测提示“三系细胞均减低”,行骨髓穿刺检查,结果提示“粒系增生减低,可见疑似利杜氏小体样包涵体”,考虑不除外“黑热病”,建议上级医院就诊。……
