APP下载

豇豆品种资源的InDel分子标记分析

2021-10-13康研陈珍珠赵媛何思晓马雪洁刘青青陈禅友潘磊

江汉大学学报(自然科学版) 2021年5期

康研,陈珍珠,赵媛,何思晓,马雪洁,刘青青,陈禅友,潘磊

(江汉大学生命科学学院;湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心;湖北省食用豆类植物自然科技资源中心,湖北武汉 430056)

0 引言

豇豆[Vigna unguiculata(L.)Walp.]为豆科豇豆属草本植物。作为一种重要豆类作物,豇豆耐高温干旱,在世界范围内种植广泛,包括非洲、亚洲、欧洲、美国南部地区等。豇豆是我国的优势豆类蔬菜作物之一,嫩荚和种子均可食用。因其营养丰富,既可鲜食,又适合加工,深受消费者青睐。由于播种季节长,生产周期短,对于我国8-9月夏秋蔬菜淡季市场的蔬菜供应具有重要作用。

采用DNA分子标记技术研究豇豆种质资源的遗传变异是当前关注的研究热点之一。利用显性分子标记技术如RAPD(random amplified polymorphic DNA)、ISSR(inter-simple sequence repeat)等在豇豆的研究中,已经筛选获得一批重复性好、稳定可靠的分子标记引物[1-2]。而在豇豆的共显性分子标记研究方面,如SSR(simple sequence repeat)和SNP(single nucleotide polymor⁃phism)等分子标记的发掘则报道愈来愈多。从长豇豆基因组数据库HarvEST和CGKB(http:∥cowpeagenomics.med.virginia.edu/CGKB)中发掘出了172个多态性豇豆SSR分子标记,包括45个EST-SSR标记和127个SSR标记[3-4]。有研究表明采用SNP标记可定位一批与豇豆驯化相关的基因,包括荚长、花色、果柄长度、种皮颜色等[5-6]。目前研究所揭示的豇豆种质资源的遗传变异有限,豇豆的分子生物学研究还比较滞后,尤其是在长豇豆的DNA分子标记研究方面还比较薄弱,亟待加强。

插入与缺失(InDel,insertion/deletion)标记是一种共显性分子标记,在基因组上分布广泛,密度大,适宜于进行全基因组分子标记的发掘。InDel标记可以通过凝胶电泳中的条带大小差异来确定不同的基因型。……

登录APP查看全文