李碧瀚 于 洋 刘桂嘉 罗 正 李富花①

(1. 中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 青岛 266071; 2. 中国科学院大学 北京 100049)

水产动物的经济性状大多是由微效多基因控制的数量性状, 如生长速率、抗病性等(Yue, 2014;Gjedrem, 2015)。然而数量性状易受环境等因素影响,导致了遗传评估准确率偏低。抗性性状由于表型度量困难、遗传力低, 加之与生长或其他性状之间存在负相关, 使得利用传统育种技术对抗病性状进行选育的效率较低(Cocket al, 2009)。随着分子标记, 特别是以单核苷酸多态性(SNP)标记为主的基因分型技术的发展, 分子标记辅助选择(MAS)和基因组选择(GS)等分子育种技术在水产动物抗病育种中彰显了巨大优势, 比如个体评估的准确性高, 可在繁殖周期的早期进行选择等。尽管分子育种技术优势大, 但是在大多数水产动物的商业化育种中的应用仍然较少。在水产动物中开展高效分子育种面临着两大难点, 一者是缺少高密度、高精度的性状连锁标记(Meuwissenet al,2004), 二者是对标记和性状之间关联程度的评估有待优化(VanRadenet al, 2009)。因此鉴定与性状紧密相关的基因或基因位点是水产动物分子育种亟需解决的问题。

鉴定性状相关位点的主要方法包括全基因组关联分析(GWAS)和候选基因关联分析(Xuet al, 2009)。其中, GWAS 已经在人类疾病相关基因的鉴定和农作物、畜禽经济性状相关SNP 鉴定中得到广泛应用, 而水产养殖物种中GWAS 研究起步较晚, 主要应用于罗非鱼、大西洋鲑鱼、鲤鱼和太平洋牡蛎等几种研究基础较好的水产物种(Houstonet al, 2020)。……