吴至成 王乙妃 吴琳

摘要：解析一株从临床病人血液标本里筛查出来的菌株T6000的基因组序列信息，并对其进行群体感应信号合成酶的基因检测。使用Illumina Miseq测序平台获取该菌的全基因组序列，将其全基因组序列经过注释的基因蛋白质序列提交KEGG数据库进行BLASTp比对分析，确定该菌潜在的重要感应信号合成酶。结果表明：t6000基因组序列全长6074257 bp，其中GC所占的百分比为42.88%。生物信息学分析结果表明t6000具有13种重要感应信号合成酶及致病机理，为药物靶位点的确立及新药的研发奠定理论基础。

关键词：多形拟杆菌;基因组测序;感应信号基因

厌氧菌在某些特定情况下可由正常菌群变为条件致病菌，约占临床内源性细菌感染50-60%，其中类杆菌属细菌分离率最高，常与其他细菌混合感染，造成腹腔内、骨盆及皮肤等感染，有很高的发病率和致死率[1-3]。類杆菌属有超过20种，以脆弱类杆菌、多形类杆菌、普通类杆菌等在临床感染最为常见。

群体感应（quorum sensing， QS）是广泛存在于细菌群体中的依赖细菌密度的信号通讯系统，可通过感知其浓度变化来调节群体行为的现象，如致病菌定植、毒力因子的表达、耐药性和胞外酶的产生，群集运动，生物膜形成和生物发光等[3，4]。因此，研发类杆菌属细菌的的QS系统为新型药物的治疗靶点，可更好地控制细菌群体感染及耐药性的产生，是今后研究的一个重要方向。本研究从临床血液标本中分离出类杆菌t6000，通过Illumina测序平台对其全部基因组进行测序，然后使用相关软件对测序数据进行QS合成酶基因组组装和编码基因预测，以期了解t6000的群体感应信号的类型和作用机制。……