APP下载

白术芍药散作用靶点及分子机制的网络药理学研究

2021-08-31陆丽娟通讯作者

医药前沿 2021年19期
关键词:分析

陆丽娟,史 敏(通讯作者)

(1苏州大学附属儿童医院药剂科 江苏 苏州 215003)

(2南京中医药大学附属苏州市中医医院<苏州市吴门医派研究院中药临床药学实验室> 江苏 苏州 215009)

白术芍药散由白术、白芍、陈皮、防风4味药组成,因其治疗腹痛泄泻效果较好又得名“痛泻要方”,具有补脾柔肝,调和气机,祛湿止泻之功效[1]。临床常用来治疗各种原因导致的腹泻、肠炎等消化系统疾病。现代药理学发现白术芍药散有镇痛、抗炎、止泻、抗肿瘤等作用。网络药理学从中药多成分、多靶标、多途径方面阐释药物作用机制,有助于在系统层次和分子水平揭示药效物质基础与作用机理[2]。本文基于网络药理学方法对白术芍药散药物作用机制进行分析。

1.方法

1.1 筛选化学成分并预测靶蛋白

借助中药系统药理学数据库TCMSP Version: 2.3,分别以“白术、白芍、陈皮、防风”为关键词,得到化合物白术55种,白芍85种,陈皮63种,防风173种。以生物利用度(OB)和类药性(DL)为筛选阈值得到候选化合物。基于TCMSP服务器预测其潜在靶点,同时使用蛋白质数据库,获得相关靶点蛋白信息。

1.2 构建化合物-靶点及蛋白相互作用(PPI)网络

为了进一步分析靶点蛋白在整体水平上的作用,将1.1中得到的120个基因上传至STRING11.0(https://string-db.org/)数据库。物种设为“人”,最低相互作用选择confidence≥0.7,其余参数保持默认设置。将互作关系数据导入Cytoscape3.2.1软件,利用Cytohubba插件获得度值前5的关键靶点蛋白作进一步分析,靶点的度值表示相互作用的靶点个数。

1.3 GO-BP和KEGG通路富集分析

本研究采用David 6.8数据库(https://david.ncifcrf.gov/)对靶点蛋白进行GO-BP富集分析和KEGG通路富集分析。以“P<0.01,基因数大于13”作为筛选条件,得到白术芍药散靶点主要的生物功能及可能性较大的信号通路,并且利用R软件对GO-BP富集分析中的GO条目和KEGG通路绘制气泡图。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

分析
禽大肠杆菌病的分析、诊断和防治
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
电力系统不平衡分析
电力系统及其自动化发展趋势分析
经济危机下的均衡与非均衡分析
对计划生育必要性以及其贯彻实施的分析
GB/T 7714-2015 与GB/T 7714-2005对比分析
网购中不良现象分析与应对
中西医结合治疗抑郁症100例分析
伪造有价证券罪立法比较分析