白术芍药散作用靶点及分子机制的网络药理学研究
2021-08-31陆丽娟通讯作者
陆丽娟,史 敏(通讯作者)
(1苏州大学附属儿童医院药剂科 江苏 苏州 215003)
(2南京中医药大学附属苏州市中医医院<苏州市吴门医派研究院中药临床药学实验室> 江苏 苏州 215009)
白术芍药散由白术、白芍、陈皮、防风4味药组成,因其治疗腹痛泄泻效果较好又得名“痛泻要方”,具有补脾柔肝,调和气机,祛湿止泻之功效[1]。临床常用来治疗各种原因导致的腹泻、肠炎等消化系统疾病。现代药理学发现白术芍药散有镇痛、抗炎、止泻、抗肿瘤等作用。网络药理学从中药多成分、多靶标、多途径方面阐释药物作用机制,有助于在系统层次和分子水平揭示药效物质基础与作用机理[2]。本文基于网络药理学方法对白术芍药散药物作用机制进行分析。
1.方法
1.1 筛选化学成分并预测靶蛋白
借助中药系统药理学数据库TCMSP Version: 2.3,分别以“白术、白芍、陈皮、防风”为关键词,得到化合物白术55种,白芍85种,陈皮63种,防风173种。以生物利用度(OB)和类药性(DL)为筛选阈值得到候选化合物。基于TCMSP服务器预测其潜在靶点,同时使用蛋白质数据库,获得相关靶点蛋白信息。
1.2 构建化合物-靶点及蛋白相互作用(PPI)网络
为了进一步分析靶点蛋白在整体水平上的作用,将1.1中得到的120个基因上传至STRING11.0(https://string-db.org/)数据库。物种设为“人”,最低相互作用选择confidence≥0.7,其余参数保持默认设置。将互作关系数据导入Cytoscape3.2.1软件,利用Cytohubba插件获得度值前5的关键靶点蛋白作进一步分析,靶点的度值表示相互作用的靶点个数。
1.3 GO-BP和KEGG通路富集分析
本研究采用David 6.8数据库(https://david.ncifcrf.gov/)对靶点蛋白进行GO-BP富集分析和KEGG通路富集分析。以“P<0.01,基因数大于13”作为筛选条件,得到白术芍药散靶点主要的生物功能及可能性较大的信号通路,并且利用R软件对GO-BP富集分析中的GO条目和KEGG通路绘制气泡图。……
