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草原1号杂花苜蓿花蕾转录组SSR序列特征

2021-08-26石凤翎乌日娜

西北农林科技大学学报(自然科学版) 2021年8期

徐 舶,石凤翎,乌日娜,乔 雨,王 佳

(内蒙古农业大学 草原与资源环境学院,草地资源教育部重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010019)

苜蓿(Medicago)为豆科多年生草本植物, 是世界上栽培历史最悠久、营养价值最高的优良牧草之一, 具有生态和商业双重价值[1]。栽培苜蓿的主要育种目标是提高饲草品质和增加产量[2],但由于苜蓿基因组高度杂合、遗传分析复杂,导致品种更新换代慢,很难提高草料品质和产量[3]。此外,苜蓿的品质和产量性状受数量性状基因座(QTL)的调节,而QTL会受到环境变化的影响[4],这使得对品质和产量性状的选择育种变得更加困难。分子标记与植物基因型密切相关,受环境因素的影响较小[5],目前已被广泛应用于辅助育种[6]、品种鉴定[7]、基因组图谱构建[8]及靶区域的位置克隆[9]等研究,这为栽培苜蓿的改良提供了一条新的途径[10]。

简单重复序列(SSR)或微卫星SSR是DNA序列中1~6个核苷酸的短串联重复序列,其重复数目高度可变,而其侧翼区域高度保守[11]。SSR标记是基于聚合酶链反应(PCR)的高度可复制的共显性标记,因其丰富的多态性和多等位性而被广泛用于种质遗传多样性分析和标记辅助选择育种[12],利用高通量测序技术开发SSR引物在褐沙蒿[13]、红豆草[14]、橡胶草[15]等牧草中均有报道。当前,在苜蓿中应用的SSR标记多从紫花苜蓿[16]和蒺藜苜蓿[17]基因组文库中获得,其标记数量较为有限,且随着近几年我国苜蓿品种登记数量的逐渐增多(目前我国登记品种超过100个),为满足苜蓿种质资源鉴定及提高育种选择效率的需要,有必要开发新的分子标记。……

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