李雨晨，白丽莲，黄荷凤，刘欣梅

上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院妇产科，上海市胚胎源性疾病重点实验室，上海 200030

胸腺是建立适应性免疫及自身免疫耐受的关键器官。T细胞在胸腺内的分化有赖于以胸腺上皮细胞（thymic epithelial cell，TEC）、成纤维细胞（fibroblast，Fb）和树突状细胞（dendritic cell，DC）等为代表的胸腺基质细胞形成功能健全的微环境［1］。在胸腺内，分化中的T细胞在TEC诱导下完成T细胞受体（T cell receptor，TCR）基因重排形成TCR组库，并识别由TEC和DC等抗原提呈细胞（antigen-presenting cells，APC）通过主要组织相容性复合物（major histocompatibility complex，MHC）提呈的自身抗原肽，作出适当强度的免疫反应，完成阳性选择和阴性选择，获得成熟的免疫反应功能，并清除自身反应性T细胞，建立免疫系统稳态［2］。

人类胸腺皮质和髓质TEC分化大约始于胚胎第8周，10～12周时皮、髓质分界逐渐清晰；12～15周时，胸腺淋巴细胞数量达到高峰，T细胞在趋化因子作用下向外周淋巴组织迁移［3］。胸腺的体积于青春期达到高峰，并在成年后逐渐退化［4］。了解胸腺的发育和退化，对于研究机体免疫稳态的维持、自身免疫疾病的发生规律和免疫功能重建等方面均有重要意义［5］。

由于正常人类胸腺样本不易获取，过去对胸腺发育和退化的研究主要来自小鼠等模式生物，并且通常局限于整个组织水平或分选的特定细胞类型［6-7］。近年来，单细胞RNA测序（single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）技术的发展使得我们能从少量组织样本中获得单细胞分辨率的转录组图谱，以揭示生物学过程中的细胞异质性［8-10］。尽管目前已有针对人类胸腺的scRNA-seq研究发表，且覆盖了从胚胎至成年的各个生命时期，但这些研究倾向于将来自不同发育时间点的样本进行整合分析，而忽略了由发育阶段变化造成的生物学差异［11-12］。……