聂承冬，温 静，周婉梅，徐蓓蕾，杨 波，侯兵乔，王淇漩，阎新佳*

(1. 哈尔滨商业大学 药学院，哈尔滨 150076；2. 黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室，哈尔滨 150076)

败酱草(PatriniavilloseJuss.，或者Patriniascabiosaefolia Fisch.ex Link)具有排脓消痈和清热解毒等功效[1-2].现代临床上，多用于溃疡性结肠炎、胃炎、直肠炎的治疗等，其中尤为溃疡性结肠炎治疗效果显著[3-4].败酱草在治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis，下文简称UC)的大量数据表明，其在临床使用、体外实验和体内实验等都具有显著的疗效[5-7].

本文以网络药理学和分子对接工具为基础[8]，探讨败酱草疗法UC作用机制和药效物质基础.由于近几年网络学的流行，可使用工具也愈来越复杂，各不相同.算法的不同，来源的差距也很大，故本文对获得成分靶点的多种工具作了对比，希望研究人员可以针对这些工具来进行反复的研究.

1 材料和方法

1.1 败酱草成分筛选

基于TCMSP数据库(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)[9]，SymMap(https://www.symmap.org/)[10]，TCMID(http://119.3.41.228:8000/tcmid/)，TCM@Taiwan(http://tcm.cmu.edu.tw/ index.php)[11]对败酱草的成分筛选，得到败酱草的主要成分.

1.2 败酱草靶点获取

基于已有数据库文本挖掘成分靶点，利用TCMSP，SymMap，TCM@Taiwan CancerHSP(http://tcmspw.com/CancerHSP.php)和PubChem(http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)数据库获取作用靶点；基于常见成分靶点预测工具(PharmMapper，Swiss Target Prediction，TargetNet，SITCH)获取成分靶点.

PharmMapper[12-14](http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/)筛选物种为Homo sapiens，其余默认；Swiss Target Prediction[15](http://www.swiss target prediction.ch/)选择species为Homo sapiens，Prob > 0.095，其余默认；Target Net[16-17](http://targetnet.scbdd.com /calcnet/index/)选择species为Homo sapiens，Include models with:AUC >= 7，Fingerprint type:ECFP4 fingerprints，Prob > 0.095，其余默认；SITCH[18](http://stitch.embl.de/)选择species为Homo sapiens，minimum required interaction score：high confidence (0.700)，其余默认.再通过Uniprot(https://www.uniprot.org)进行信息校正，保留species为“homo sapiens”的靶点，得到败酱草主要成分靶点.

1.3 疾病成分靶点的筛选

以“ulcerative colitis”为关键词，在DrugBank(https://www.drugbank.ca/)[19]，TTD(http://db.idrblab.net/ttd/)[20]，DisGeNET(https://www.disgenet.org/)[21]，MalaCards(https://www.malacards.org/)[22]，GeneCards(https://www.genecards.org/)[23]，OMIM[24](https://omim.org/)中检索UC靶点，再通过Uniprot数据库进行靶点信息校正和去重.

1.4 主要成分-靶点网络的构建

将UC靶点和主要成分分别引入Cytoscape (3.7.2)，组建网络(“成分-作用靶点”).通过“自由度(free degree)”筛选出败……