基于网络药理学的爵床抗肿瘤活性成分及作用机制研究
2021-08-06胡进陈辉张欢谢周涛
胡进 陈辉 张欢 谢周涛
中药爵床为爵床科植物爵床Rostellularia procumbens (L.) Nees的干燥全草,是传统的中草药。爵床具有清热解毒、利尿消肿之功效,临床用于治疗感冒发热、咽喉肿痛、痢疾、肠炎、肾盂肾炎等症,外用治疗痈疮疖肿等[1]。爵床全草的现代研究表明,其主要化学成分为木脂素及其苷类、黄酮类、生物碱、三萜类化合物等。现代药理研究表明,爵床具有抗肿瘤、抗病毒、抗菌等多种生物活性[2],目前爵床的药理作用研究仍不够系统与全面。
网络药理学作为一种系统性、整体性的研究药物、疾病、靶点之间相互关系的分析方法,与中药多成分、多靶点、多途径作用特征相吻合,可系统发掘中药潜在活性成分和作用靶点[3,4]。我们采用网络药理学的研究方法,预测爵床抗肿瘤的活性成分、治疗靶点和信号通路,并使用分子对接进行验证。
1 材料与方法
1.1 化学成分库构建通过检索国内外相关文献,构建爵床的化学成分库,结合 Pubchem数据库,采用 Chemoffice软件绘制成分的化学结构并保存为MOL2格式。
1.2 活性成分筛选药物的体外筛选模型主要涉及药物的肠吸收、血脑屏障渗透性、体外代谢、药物相互作用和各种体外毒性模型等,并以人体肠道吸收(HIA)、Caco-2细胞渗透性(简称Caco-2)和血浆蛋白结合(PPB)作为关键参数进行筛选[5]。将该格式的化合物导入 https://preadmet.bmdrc.kr/网站,计算并预测药物吸收、分布及代谢。筛选出HIA大于20,Caco-2渗透性大于4和PPB大于70的所有化学成分作为候选药效成分。
1.3 药效成分靶点预测将筛选好的各成分的MOL2结构导入 Pharm Mapper服务器中,采用反向药效团匹配方法进行靶点预测,将匹配得分靠前的靶点在Uniprot数据库进行检索,限定物种为人,对靶点名称进行统一。……
