肺栓塞患者差异甲基化位点及区域分析*
2021-08-06曹国磊何丽丽马荣辉曹嘉瑞牛海文
曹国磊, 何丽丽, 马荣辉, 唐 乐, 曹嘉瑞, 牛海文, 罗 琴
新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸与神经内科,乌鲁木齐 830011
肺血栓栓塞症(pulmonary thromboembolism,PTE)是呼吸系统疾病中比较常见的一种血管疾病,是由于各种原因导致的血栓栓子堵塞肺动脉干或其分支,引起肺循环障碍的临床、病理生理综合征[1-2]。研究显示,近年来国内PTE的患病率、疾病构成比均显著增长[3]。高达15%的PTE患者在患病后1月内死亡,30%的患者在未来10年内复发[4]。
DNA甲基化是在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMT)的催化作用下,二核苷酸中C核苷酸上第5个碳原子发生甲基化转变,成为甲基化的胞嘧啶[5]。研究证明,DNA的异常甲基化在恶性肿瘤、自身免疫性疾病及心血管疾病中发挥着重要作用[6],但关于其与PTE关系的研究却罕见报道。本研究拟通过Illumina Infinium Methylation EPIC Bead Chip芯片(850K芯片)甲基化检测平台在全基因组水平检测PTE患者与正常对照者每个CpG位点的甲基化水平,并对比分析PTE患者与正常对照组之间差异甲基化位点、区域及其目的基因,进一步揭示PTE的发病机制。
1 材料与方法
1.1 一般资料
纳入标准:经肺动脉CT血管造影确诊肺动脉存在血栓,无心脑血管疾病史,无内分泌疾病史。对照组选取标准:选取与PTE组性别比例、年龄相当,既往无心脑血管、血液、内分泌、肝肾疾病,且无慢性阻塞性肺疾病(COPD)、哮喘等病史的相同地区人群作为正常对照组。所有入组人员均签署相关知情同意书,并经新疆医科大学附属肿瘤医院伦理委员会批准(伦理审批号为:2019BC007)。收取2019年1月至2019年12月就诊的肺栓塞患者和正常对照人群外周血标本各10例,进行DNA提取。……