一起人腺病毒55型引起的儿童发热暴发疫情病原学鉴定
2021-07-29刘师文熊英李健雄张艳妮徐刚肖芳刘晓庆龚甜
刘师文,熊英,李健雄,张艳妮,徐刚,肖芳,刘晓庆,龚甜
(江西省疾病预防控制中心疾病检测所,江西 南昌 330029)
人腺病毒55型(Human adenovirus type 55,HAdV-55)是2006年中国首次在呼吸道感染疫情中分离鉴定的一个新基因型人腺病毒[1]。该病毒是由腺病毒B组HAdV-14和HAdV-11重组进化而来,其基因骨架来自引起呼吸道感染的HAdV-14,部分六邻体(Hexon)基因来自引起泌尿道感染的HAdV-11[2]。HAdV-55感染主要导致急性呼吸道感染以发热、咳嗽、咽痛和咳痰为主要临床表现,易并发肺炎[3]。与亲本HAdV-14及呼吸道腺病毒HAdV-3、HAdV-7相比,HAdV-55的传播能力更强,发热和肺炎的比例更高,暴发流行的规模更大[3,4]。流行病学调查研究显示HAdV-55暴发以成人为主[5-7],未见引起儿童暴发疫情的报道。
2020年8月江西某地出现一起儿童发热暴发疫情,本实验室根据临床症状和流行病学史,采集了3例患儿咽拭标本,采用TaqMan微流体芯片、病毒分离及全基因组测序技术对这起疫情的病原体进行鉴定,报告如下。
1.1 标本采集2020年8月21-8月24日江西省宜某县29名儿童先后出现发热,不同程度咽痛症状,所有儿童均于8月9日-8月23日在同一游泳馆学游泳。采集3例具有发热(38.5℃~40℃)、咽痛症状的患儿(7~9岁)咽拭子标本,冷藏运输条件下运送至本实验室进行检测。
1.2 核酸提取 采用Qiagen公司的QIAamp MinElute Virus Spin Kit试剂提取咽拭子样本和病毒分离物的核酸,具体操作参照试剂说明书。
1.3 病原种类确定 采用TaqMan Gene Expression Custom Array Card(Cat No:4342253,美国Applied Biosystems公司)微流体芯片技术对样本进核酸检测,病原包括腺病毒、流感病毒、冠状病毒、肺炎衣原体、肺炎链球菌等42种呼吸道病原体。根据TaqMan Fast Virus 1-Step Master Mix(Cat No:4444 432,美国Applied Biosystems公司)说明书要求配置预混液。……
