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尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位

2021-07-28朱显亮周长品贾翠蓉翁启杰李发根

南京林业大学学报(自然科学版) 2021年4期
关键词:关联生长

朱显亮,周长品,贾翠蓉,翁启杰,李发根

(中国林业科学研究院热带林业研究所, 热带林业研究国家林业和草原局重点实验室,广东 广州 510520)

桉树起源于澳大利亚及其附近岛屿,是桃金娘科(Myrtaceae)桉属(Eucalyptus)、杯果木属(Angophora)和伞房属(Corymbia)的总称[1-2]。我国自1890年引种桉树,至今已有100余年历史[3]。据全国第9次森林资源清查,我国桉树人工林面积已达546万 hm2,占全国人工林总面积6.8%。桉树是我国重要的工业用材树种,其生长和材性性状是重要的经济性状,直接影响人工林产量及纸浆产量和质量,对于桉树生长和材性的遗传改良一直备受育种者重视。在桉树中,对巨桉(E.grandis)已完成全基因组测序[4]。同时,研究者在多个桉树群体的种源、家系及无性系间进行了生长及材性性状遗传分析,但不同群体的分析结果不尽相同[5-8]。目前为止,对于桉树中许多重要经济性状的遗传基础及调控机理都知之甚少。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)是指基因组水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性[9]。SNP具有分布密度高、遗传稳定性强、易于高通量检测和分型的特点[10]。利用SNP标记研究桉树复杂性状遗传变异规律,对于揭示桉树重要性状的分子调控机制具有重要意义。关联分析是进行复杂性状解析的一种有力工具,利用关联分析可获得与目标性状紧密相关的分子标记或候选基因[11]。目前,利用关联分析已在桉树生长[12-13]、材性[14-16]、抗病性[17-18]等方面开展研究,挖掘了一些与生长和材性相关联的位点和候选基因。但林木的生长与木材的形成受复杂多层次网络调控和微效多基因控制,可能有大量的基因参与其中[19],仍需加大力度开展桉树重要经济性状候选基因的发掘。……

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