林 欢，冯旰珠

南京医科大学第二附属医院呼吸与危重症医学科，江苏 南京 210011

2019年12月，中国湖北省武汉市出现了病因不明的肺炎暴发。一种新型冠状病毒被确认为病原体，该病毒可影响下呼吸道，并在人类中表现为肺炎，2020 年2 月世界卫生组织（World Health Organization，WHO）将该病命名为新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 19，COVID-19），同年3 月国际病毒分类委员会（International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）冠状病毒研究小组正式将该病毒命名为“SARS-CoV-2”。尽管全球进行了严格的控制和隔离，该病仍在世界各地迅速蔓延。SARSCoV-2 隶属于冠状病毒种属，此病毒因在电子显微镜下呈现出包膜上有形状类似日冕的棘突而得名。目前，研究者发现病毒颗粒由4种蛋白组成，包括刺突蛋白（spike，S）和膜蛋白（membrane，M）两种主要的糖蛋白、非糖基化的包膜蛋白（envelope，E）及负责病毒RNA 复制的核衣壳蛋白（nucleocapsid，N）（图1［1］）。S蛋白在SARS-CoV-2与宿主细胞血管紧张素转化酶2（angiotensin-convertingenzyme2，ACE2）受体结合、膜融合、病毒内化、组织嗜性及其致病性方面至关重要，因此成为疫苗研制及中和抗体开发抗体主要靶标。

图1 冠状病毒结构Figure 1 The coronavirus structure

1 S蛋白的结构

2012 年ICTV 根据冠状病毒的基因组结构将其分成4个属：α属转录调控序列（transcription regulating sequences，TRS）均为CUAAAC，具有2个蛋白酶位点；β属A群TRS为CUAAAC，而其他群为ACGAAC和非结构蛋白3（non-structural protein 3，NSP3），但β属只有1个蛋白酶位点；γ属TRS为CUUAACAA，都缺少NSP7；δ属是已知最小基因组，其结构类似其他病毒。21 世纪以来，造成重症急性呼吸综合征（severe acute respiratory syndrome，SARS）的SARS-CoV、中东呼吸综合征（middle east respiratory syndrome，MERS）的MERS-CoV 及SARS-CoV-2 病毒均属于β属。研究发现，同属于冠状病毒的SARS-CoV-2 与SARS-CoV 具有很高的序列同源性（约79.5%）［2］。SARS-CoV-2 的基因组编码pp1ab（从ORF 1ab 进行翻译），4 个结构蛋白（S、E、M 和N）和6 个辅助蛋白（3a、6、7a、7b、8 和10），与SARS-CoV 和MERS-CoV相同，SARS-CoV-2也没有血凝素-酯酶（HE）基因［3］。……