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基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析

2021-07-28代小冬朱灿灿宋迎辉王春义代书桃李君霞

核农学报 2021年8期
关键词:植物研究

代小冬 朱灿灿 宋迎辉 王春义 代书桃 秦 娜 李君霞

(河南省农业科学院粮食作物研究所,河南郑州 450002)

干旱是限制作物生长发育的主要非生物逆境灾害[1]。随着气候变化和世界人口的不断增长,水资源短缺的问题更加突显,干旱发生的频率和严重程度将会进一步加剧[2]。因此,解析作物抗旱机制、培育抗旱作物品种对减轻干旱灾害及其造成的损失具有重要的意义。

谷子[Setaria italica(L.) Beauv]起源于中国,迄今已有8 700 多年的栽培历史[3]。谷子是二倍体自花授粉植物,且拥有较小的基因组(约430 Mb)。谷子具有生育期短、单株籽粒多、适应性广、抗旱、耐瘠薄等特点,使其渐渐成为抗旱研究的模式作物。在抗旱性鉴定方法方面,前人相继确立了谷子萌芽期[4-5]、孕穗期[6]和全生育期[7]的抗旱性鉴定指标,并进行了抗旱性鉴定。在抗旱相关QTL 定位方面,Qie 等[8]利用豫谷1 号与青狗尾草构建的重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体定位到18 个与谷子抗旱相关的QTL。在参与谷子抗旱的功能基因与蛋白挖掘方面,Tang 等[9]对抗旱品种豫谷1 号和干旱敏感品种安04 在干旱条件下的转录组进行分析,并结合抗旱相关QTL 定位结果,确定了20 个抗旱候选基因。赵晋锋等[10]研究认为SiCIPK19 基因参与了谷子拔节期、抽穗期和灌浆期对干旱胁迫的响应,推测该基因参与谷子对非生物逆境的应答,尤其在抽穗期和灌浆期干旱胁迫应答中发挥重要作用。Wang 等[11]通过对谷子中149 个bHLH 转录因子的研究,发现其可能通过调控下游抗旱基因的表达参与谷子的抗旱反应。……

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