基于网络药理学探讨澳洲茄碱抗肿瘤机制
2021-07-21高聚伟
高聚伟 徐 凯 冉 冉
恶性肿瘤严重危害人类健康,据统计全球每年新发恶性肿瘤1808 万例,死亡956 万例,而中国分别占新发的23.7%和死亡的30%[1]。中医辨治肿瘤经验丰富,是我国肿瘤治疗重要组成部分。中药通过多靶点、多途径、多效应抗肿瘤,在肿瘤防治中应用广泛。澳洲茄碱(solasonine,SS)是传统抗癌中药龙葵(Solanum nigrum L.)的主要抗癌成分,研究表明,澳洲茄碱通过抑制细胞增殖、诱导细胞凋亡、阻断细胞周期等机制,在膀胱癌、肝癌、胃癌等多种癌肿中发挥抗肿瘤效应[2-5]。澳洲茄碱抗肿瘤作用靶点及机制目前未完全明确。因此,本研究利用网络药理学方法,对澳洲茄碱抗肿瘤作用靶点及机制进行研究,为澳洲茄碱进一步实验研究和临床使用提供依据,现报道如下。
1 资料与方法
1.1 澳洲茄碱药物靶点筛选 使用TCMSP 数据库(https://tcmspw.com/tcmsp.php)获得澳洲茄碱mol2 结构,导入Pharm Mapper 数据库(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/),取Norm Fit 预测得分大于0,经uniprot 数据库(https://www.uniprot.org/)对靶点名称矫正统一,筛选出澳洲茄碱潜在靶点。
1.2 肿瘤疾病靶点筛选 以“cancer”为关键词,使用OMIM(https://omim.org/)、Genecards 数据库(https://www.genecards.org/)检索,获得疾病作用靶点。
1.3 澳洲茄碱-肿瘤共同靶点筛选及“疾病-靶点-成分”网络构建 在Venny2.1 在线软件作图工具平台(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)上输入澳洲茄碱潜在靶点及肿瘤疾病靶点,绘制韦恩图,两者交集即为澳洲茄碱-肿瘤共同靶点。将澳洲茄碱潜在靶点和澳洲茄碱-肿瘤共同靶点输入Cytoscape3.7.2软件中,绘制“疾病-靶点-成分”相互作用网络图。
1.4 澳洲茄碱-肿瘤蛋白相互作用网络构建及基于聚类分析的核心靶点筛选 将澳洲茄碱-肿瘤共同靶点输入……
