SEMA4D与头颈部鳞状细胞癌发生发展的生物信息学研究
2021-07-17石凤王俊利董明右庞晓霞李兰李光景杨凤莲
石凤,王俊利,董明右,庞晓霞,李兰,李光景,杨凤莲
(1. 右江民族医学院研究生学院,广西 百色 533000;2. 右江民族医学院医学检验学院,广西 百色 533000;3. 右江民族医学院药学院,广西 百色 533000)
头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)是一种常见的头颈部恶性肿瘤,包括口腔肿瘤、口咽肿瘤、喉部肿瘤和鼻咽癌,每年约有700 000新增病例数[1]。HNSCC的早期临床症状不明显,大多数发现时已进展为中晚期,常累及淋巴结转移,HNSCC的预后较差,晚期治疗的常规手段包括手术、放化疗等[2],对患者的身心健康产生很大的影响。轴突导向蛋白4D(semaphorin 4D,SEMA4D)属于信号素家族成员第Ⅳ类,是一种跨膜糖蛋白,大小为150 kDa。SEMA4D包含SEMA结构域,半胱氨酸富集区、免疫球蛋白结构域、跨膜区和氨基酸末端信号结构域。SEMA4D存在两个受体CD72和PlexinBi,配体与受体相结合,通过信号转导通路参与神经系统的调节、免疫细胞的活化、肿瘤新生血管的形成及促进肿瘤的生长、侵袭和迁移能力[3]。近年来,越来越多的研究表明SEMA4D在前列腺癌、乳腺癌和结直肠癌中高表达[4]。Zhang C等[5]研究发现SEMA4D通过促进HNSCC的上皮-间质细胞转化,进而促进HNSCC的转移。HNSCC是一种复杂的头颈部肿瘤,然而,SEMA4D在HNSCC中的相关性研究较少且其具体作用机制仍需进一步阐明,因此,本研究将通过来自于肿瘤基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据库进行分析SEMA4D在泛癌中的表达、SEMA4D与HNSCC的免疫细胞浸润情况以及对HNSCC患者的生存期进行相关性分析。
1 材料与方法
1.1 数据获取 从UCSC Xena官网(https://xena.ucsc.edu/)提取HNSCC等33个肿瘤的GDC TCGA数据。所有的研究数据来源于TCGA公共数据库,该数据库数据对外开放,因此,不需要相关医学伦理委员会批准。……
