苦荞蛋白磷酸酶2C家族的鉴定及表达分析
2021-07-15刘耀东肖书雅王安虎李小意刘志斌李旭峰王健美
刘耀东, 肖书雅, 王安虎, 刘 宇, 方 阳, 李小意, 刘志斌, 李旭峰, 王健美, 杨 毅
(1.四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室, 成都 610065; 2.西昌学院, 西昌 615000)
1 引 言
蛋白磷酸酶2C(protein phosphatases 2C, PP2C)依赖于Mg2+/Mn2+离子,是蛋白磷酸酶中极其重要的一支[1]. 从原核生物到真核生物,PP2C参与各种有意义的生命调控活动,在植物中,PP2C是蛋白磷酸酶最大的一个分支[2]. 植物PP2C被认为是蛋白信号级联反应中的负调控因子,也在激素信号转导过程中扮演重要角色[3]. 此外,植物PP2C还能调控植物的生长发育,包括种子萌发和根系发育[4-5]. 植物PP2C基因家族之前有很多研究,例如拟南芥(Arabidopsisthaliana)、水稻(Oryzasativa)和大豆(Glycinemax)[6-8]. 但是苦荞PP2C基因家族的研究未见报道.
苦荞(Fagopyrumtataricum)是一种药食兼用的粮食,与甜荞(Fagopyrumesculentum)相比,它更富含维生素B和芦丁,这些成分有助于降低高血压和缓解动脉硬化[9],并且苦荞对恶劣环境有很强的耐受力,而PP2C的A亚族是ABA信号通路中的核心成员,参与植物逆境胁迫应答[10-12]. 苦荞的基因组测序已经完成,加快了苦荞抗逆的机制研究. 本研究参考拟南芥PP2C基因家族信息,通过生物信息学方法在苦荞中全基因组中鉴定出81个PP2C成员,并分析了理化性质、基因结构、保守结构域、保守基序分布、染色体定位、进化情况等. 同时,通过qRT-PCR对苦荞PP2C的A亚族基因组织特异性表达和ABA处理后受诱导情况进行了分析. 这些结果对苦荞PP2C基因家族的后续研究奠定了基础.
2 材料和方法
2.1 材 料
实验使用的苦荞种子为西荞1号,由西昌学院王安虎老师提供. 所……