王何瑜, 龚一富, 郑小恽, 李申睿

三角褐指藻1基因生物信息学分析及表达调控研究

王何瑜1, 龚一富2,3*, 郑小恽2,3, 李申睿2,3

（1.宁波大学 食品与药学学院, 浙江 宁波 315832; 2.宁波大学 海洋学院, 浙江 宁波 315832; 3.浙江省海洋生物工程重点实验室, 浙江 宁波 315832）

本研究采用转录组测序获得了三角褐指藻1基因cDNA全长序列(GeneBank登录号: 7200924), 并对其进行生物信息学分析和表达调控研究. 结果表明, 三角褐指藻1基因cDNA序列全长为1438bp, 开放阅读框(ORF)为1098bp, 编码365氨基酸序列, 含有脂肪酸蛋白特性(I)和DAG结合位点(II)等功能结构域. 预测三角褐指藻DGAT1蛋白为亲水性蛋白, 含有6个跨膜结构域和7个超强跨膜螺旋区, 无信号肽. 进化树分析表明, 三角褐指藻与海链藻DGAT1蛋白同源性最高. RT-qPCR结果表明, 光照强度和温度均显著促进三角褐指藻1基因的表达. 随着光照强度和温度的增加, 三角褐指藻1基因的表达量呈先升高后降低趋势, 在光照强度为2500lx或温度为25℃时, 三角褐指藻1基因的表达量达到最大, 这与三角褐指藻总脂含量的变化趋势一致, 同样揭示DGAT1蛋白与三角褐指藻总脂生物合成与积累密切相关.

三角褐指藻;1基因; 克隆; 生物信息学; 基因表达调控

二脂酰甘油酰基转移酶(Diglyceride Acyltrans- ferase, DGAT)是三脂酰甘油(TAG)合成途径中的唯一限速酶, 催化二脂酰甘油结合脂肪酸酰基形成TAG. 三角褐指藻()是海洋微藻中生长较快、脂质含量较高的藻种[1], 其油脂含量约占细胞干重的20%～30%, 是一种可以用来制备生物柴油的微藻[2]. 三角褐指藻碳储存的主要形式为……