食管癌分子分型的遗传学基础
2021-07-03李利艳李荣耀李恩民
李利艳,敬 佩,李荣耀,李恩民
1999年美国国立癌症研究所提出肿瘤分子分型的概念,即通过综合的分子分析技术进行肿瘤的分类,由以形态学为基础转变为以分子特征为基础的新的肿瘤分类系统。这一观点的提出,推动了以DNA、RNA和蛋白分子在肿瘤中差异表达为基础的分子分型研究的广泛开展。近年来,由于食管癌的遗传学研究不断深入,高通量测序技术不断完善,食管癌的分子分型研究同样发展迅速。大量文献报道了食管癌基因组测序及食管癌遗传异常的研究成果,进一步推进了食管癌变的分子机制研究,为食管癌的分子分型奠定了理论基础。
1 食管癌相关基因突变
利用全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)或全基因组外显子测序(whole exome sequencing,WES)等方法,揭示食管癌相关遗传基因的突变情况[1-5],详见表1-2。

表1 ESCC相关突变基因[1-5]

表2 EAC相关突变基因[6-7]
1.1 ESCC相关基因突变
1.1.1NOTCH1人类的NOTCH1基因位于核基因组9q34.3,是蛋白编码基因,其编码蛋白为I型跨膜蛋白,是NOTCH蛋白家族的成员,拥有细胞表面受体和基因转录因子双重功能,主要在脂肪、皮肤和脾脏等组织细胞中表达。从肿瘤相关功能的角度,NOTCH1基因归属于原癌基因的范畴。实验研究发现,NOTCH1基因的突变是ESCC中较常见的原癌基因突变。NOTCH蛋白家族,除了NOTCH 1外,还有NOTCH 2、NOTCH 3和NOTCH 4等,是细胞NOTCH信号通路关键的跨膜蛋白节点,在55%的Ⅰ期ESCC 中有突变,提示NOTCH信号通路在早期ESCC中发挥作用。2016年,Song等用二代测序技术(next generation-sequencing,NGS)分析了104例中国ESCC中NOTCH1基因的突变情况,发现该基因的突变与细胞的分化、病程、癌细胞局部淋巴结转移相关,且NOTCH1基因突变的食管癌患者相较于未突变患者生存期短、化疗抵抗[12]。……
