郝亚娟，刘颖斌

1.上海交通大学医学院附属新华医院普外科，上海市胆道疾病研究中心，上海200092；2.上海市胆道疾病研究重点实验室，上海200092；3.上海交通大学医学院附属仁济医院胆胰外科，癌基因与相关基因国家重点实验室，上海市肿瘤研究所，上海200120

RNA 修饰在生命活动和疾病发生、发展中发挥着重要的作用。目前，已有150 多种RNA 修饰，涉及信使RNA （messenger RNA，mRNA）、非编码RNA （noncoding RNA， ncRNA）、 转运RNA （transfer RNA，tRNA）、核糖体RNA（ribosomal RNA，rRNA）、核内小RNA （small nuclear RNA， snRNA） 和核仁小RNA（small nucleolar RNA，snoRNA）。其中，甲基化修饰是一种非常广泛的修饰，约占RNA总修饰类型的2/3。甲基化修饰发生在RNA 上的位置主要是碱基的氮原子（N）、嘌呤和嘧啶的碳原子（C）、2′-OH的氧原子（O）上。氮6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenine，m6A）修饰是其中具有代表性的修饰之一。

1 RNA m6A甲基化修饰

1.1 RNA m6A甲基化修饰的特征

m6A 修饰是真核生物mRNA 中一种高丰度的表观转录组学修饰。m6A 广泛分布在自然界，包括植物、动物、原核生物和病毒中。m6A 分布在不同的RNA 类型中。在古生菌和细菌中，主要分布于tRNA 和rRNA；在真核生物中，除分布于rRNA 外，还分布于mRNA 和ncRNA 中。不同mRNA 的m6A 水平是不同的。在每1 000 个核苷酸中，约有32个GAC/AAC位点，但其中只有1～2个能被甲基化。一般mRNA 的平均长度为3 kb，测序可检测到1～5个m6A修饰［1-2］。

化学方法和m6A 免疫共沉淀高通量测序（m6Aspecific methylated RNA immunoprecipitation high throughput sequencing，meRIP-seq）发现m6A 保守的基序为RRACH（R 通常为G 和A，H 通常为A、C 和U），其中最经典的基序为GGACU。在人和小鼠细胞中，目前发现约有7 000个mRNA 存在m6A 修饰，且具有很高的保守性。meRIP-seq 揭示了这种甲基化修饰主要分布在mRNA的编码区、剪切位点附近和靠近终止密码子的3′非编码区（3′untranslated region，3′UTR）；此外，m6A 在长的外显子区也有分布［1-2］。

1.2 RNA m6A甲基化修饰酶和结合蛋白

RNA m6A 修饰是动态可逆的，发挥着重要的分子功能。……