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蓖麻高密度遗传图谱构建亲本SNP多态性分析

2021-07-01杨俊芳曹越王宙王亚张宏斌赵宜婷王宏伟

江苏农业科学 2021年9期

杨俊芳 曹越 王宙 王亚 张宏斌 赵宜婷 王宏伟

摘要:为了筛选最佳构建蓖麻高密度遗传图谱的亲本组合,以农艺性状差异较大的蓖麻两性系SL1为父本,镶嵌型雌性系HCH3和HCH1分别为母本,基于全基因组重测序(WGS)技术和生物信息学分析方法对2组亲本进行SNP标记多态性分析。结果表明,2组亲本间多态性标记均比较丰富,其中以HCH1为母本的组合2的亲本多态性更佳,SNP多态性标记总数为581 158个,可用aa×bb型SNP标记为181 791个。最佳亲本组合的确定为构建蓖麻的高密度遗传图谱、多种农艺性状定位和基因挖掘奠定了良好的基础。

关键词:蓖麻;全基因组重测序;亲本;SNP;多态性分析

中图分类号:S563.903.2   文献标志码: A  文章编号:1002-1302(2021)09-0053-05

蓖麻(Ricinus communis L.,2n=20),属于大戟科的单型蓖麻属[1],是雌雄同株异花植物,正常株蓖麻花序轴上方为红色雌花,下方为黄色雄花,圆锥花序,常异花授粉,多级分枝,无限花期。蓖麻是一种重要的能源油料作物,因其蓖麻油具有的特殊物理性质,被应用于航空、航天、军工、工程塑料、化工、纺织等数十个行业[2]。但是受困于蓖麻传统育种的局限性,在选择具有理想性状的植株,特别是多基因控制性状时,需要很长时间且缺乏精确性,蓖麻品种改良进程缓慢。分子标记辅助育种(MAS)方法可以有效地解决这些问题。遗传图谱和数量性状定位(QTL)已成为多种植物分子标记辅助育种的重要工具[3-8]。

在蓖麻上关于遗传图谱构建的研究起步较晚,研究者也较少。国内学者毕川等最早开始蓖麻图谱构建……

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