五家渠尖缘螺线粒体基因组测序分析
2021-07-01阿尔祖古丽买买提吐尔逊张子俊张卫红
阿尔祖古丽·买买提吐尔逊,张子俊,张卫红
(新疆大学 生命科学与技术学院,新疆 乌鲁木齐 830046)
尖缘螺属OxylomaWesterlund,1885隶属于腹足纲(Gastropoda),柄眼目(Pulmonata),琥珀螺科(Succineidae)。广泛分布于非洲、欧洲、北美洲及亚洲等地。在我国尖缘螺属仅报道有印度尖缘螺(Oxylomaindica(Pfeiffer,1849))、狭长尖缘螺(Oxylomapfeifferi(Rossmaessler,1835))[1-2]和五家渠尖缘螺(OxylomawujiaquensisLi,Guo & Zhang,2017)[3]。五家渠尖缘螺已知仅分布于新疆。
线粒体基因组具有自己特殊的遗传物质,呈母系遗传,结构简单。作为高频率应用于生物系统进化研究的分子标记,线粒体基因组具有编码区高度保守、拷贝数高、重组率低等特点[4-5]。目前已广泛应用于动物系统发育、物种分类、群体遗传进化、种质鉴定等领域[6]。近年来腹足纲类群线粒体基因组测序数据的增加,促进了其系统演化问题的研究[7-9]。琥珀螺科的线粒体基因组目前报道仅有一种,White等[10]对肺螺亚纲10个种类的线粒体基因组进行测序和研究,首次获得了琥珀螺科的模式种腐败琥珀螺(SuccineaputrisLinneaus,1758)的线粒体全基因序列。利用高通量测序技术对动植物基因组进行测序现在成为新的基因组研究趋势[11-13],本研究使用高通量测序Illumina Hiseq及Sanger技术,对五家渠尖缘螺线粒体全基因组进行研究。研究结果可为我国琥珀螺科的系统分类学研究提供数据基础。
1 材料和方法
1.1 试验材料
五家渠尖缘螺样本(XJU S15001)于2015年6月14日采集于新疆五家渠市青格达湖湖坝边(N44°07.736′E08°33.678′)。-20 ℃存放于无水乙醇中。
1.2 DNA提取及检测
剪取软体腹足肌肉组织约30 mg,用天根公司提供的DNA提取试剂盒提取基因组DNA。DNA经Nanodrop 2000(Thermo Fisher Scientific,USA)检测浓度及纯度。
1.3 高通量测序
检测合格的DNA样品,通过转座酶打断DNA,两端加上接头构建测序文库。……
