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基于iTRAQ 技术的肝癌细胞蛋白质组学研究

2021-06-26关媛月高玉雪陈德喜王延军

中国医药导报 2021年15期
关键词:肝癌差异分析

关媛月 高玉雪 庄 园 陈德喜 王延军

首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所,北京 100069

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是一种以体液和血液传播为主的嗜肝DNA 病毒[1],HBV 持续感染所致的肝癌是影响全球的一个重大健康问题,全世界至少超过3.5 亿是慢性HBV 的感染者[2],每年有约887 000 人死于HBV 相关的肝病。尽管已证实核苷(核苷酸)类似物(NAs)和聚乙二醇化干扰素-α(Peg-IFNα)可有效抑制HBV 复制,但NAs 需要长期服用,α 干扰素(IFNα)治疗则易产生各种副作用,且这两种药物均难以根除HBV,实现慢乙肝的临床治愈[3]。因此,研究HBV 感染相关特异性蛋白标志物,寻找新的药物治疗靶点,对于临床具有重要的意义和价值。本研究使用同位素标记相对和绝对定量(isotope tagging for relative and absolute protein quantitation,iTRAQ)技术对稳定表达HBV 的HepG2.2.15 细胞株及其亲本HepG2 细胞株进行鉴定和定量分析,筛选出差异蛋白,通过生物信息学分析差异蛋白功能及相应通路,为进一步探讨HBV 致病的分子机制提供参考依据。

1 材料与方法

1.1 细胞

HepG2 和HepG2.2.15 的肝癌细胞系于北京市肝病研究所保存。

1.2 主要仪器与试剂

高效液相色谱仪(Nano,HPLC)、Durashell-C18色谱柱(4.6 mm×250 mm,5 μm,EASY-Spray column)、质谱系统(Orbitrap Fusion)和蛋白定量染液(23238)购自美国Thermo 公司;超声波细胞破碎仪(XO)购自南京先欧仪器公司;硫脲(T7875)购自美国Sigma 公司;尿素(161-0731)购自美国Bio-Rad 公司;iTRAQ®试剂盒(4381664)和iTRAQ Reagent 8 Plex(4381663)购自美国AB Sciex 公司;DMEM 培养基(2003938)和胎牛血清(F8318)购自美国Sigma 公司。

1.3 细胞培养

用含有10%胎牛血清的DMEM 培养基进行两种肝癌细胞的培养,2~3 d 进行1 次传代,放置到含有5%CO2、37℃的培养箱中培养。

1.4 细胞蛋白质谱分析

1.4.1 细胞收集 收集处于对数生长期的细胞,按照细胞传代的方法进行消化和计数,确保细胞数达到1×107个/mL 以上,将细胞沉淀放置到-80℃的冰箱备用。……

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