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杜仲全基因组GRAS基因家族的鉴定和系统发育分析

2021-06-25张传明张宝会姚新转吕立堂

特产研究 2021年3期
关键词:分析

张传明,张宝会,姚新转,吕立堂,※

(1.贵州大学生命科学学院,贵州 贵阳 550025;2.农业生物工程研究院,山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室,山地生态与农业生物工程协同创新中心,贵州 贵阳 550025;3.贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025)

杜仲(Eucommia ulmoides)是杜仲科(Eucommiaceae)杜仲属(Eucommia)多年生落叶乔木,具有丰富的药用价值和研究价值[1]。研究发现,杜仲的根须、幼茎、嫩叶、雌雄花、果皮、果肉和树皮等组织器官含有种类繁多的活性物质,是一种用途广泛的中药材,具有滋肝养肾、调节血压和降脂减肥等作用[2-5]。杜仲抵御外界环境胁迫和生物胁迫从第三纪存活至今[6],可能与其独特的代谢产物和逆境下基因选择表达密切相关,而转录因子是调控这些作用机制的重要途径。目前已经发现许多与植物生长调节和抗逆性相关的转录因子[7],其中GRAS(gibberellic acid insensitive-repressor of gibberellic acid insensitive-scarecrow)基因作为与植物生长调控和抗逆性调节相关的古老转录因子[4],已在水稻(Oryza sativa L.)[8]、拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.][9]、大麦(Hordeum vulgare L.)[10]、陆地棉(Gossypium hirsutum Linn.)[11]、黄瓜(Cucumis sativus L.)[12]、烟草(Nicotiana tabacum L.)[13]、杨树(Populus L.)[14]、玉米(Zea mays Linn.)[15]、大豆[Glycine max(Linn.)Merr.][16]和番茄(Solanum lycopersicum Mill)[17]等植物中进行了基因家族分析,但其在杜仲中的功能作用尚待研究。

GRAS基因家族成员其蛋白序列的C端高度同源,根据GRAS基因家族成员N端的长度和序列的差异性可将其划分为多个亚族,包括调控根辐射形态的形成与发育及叶、芽发育的互作蛋白SCR(scarecrow)和SHR(short-root)[18],受赤霉素、茉莉酸和光信号影响调控植物生长发育并对植物逆境胁迫起重要调节作用的DELLA[19],参与赤霉素/DELLA调控途径并和SHR/SCR协同调控根部细胞的伸长与分裂的SCL3(scarecrow-like 3)[20],调控植……

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