基于国际疾病分类的心血管疾病亚型的基因组学研究
2021-06-22郭子宁梁志生
郭子宁,梁志生,周 仪,张 娜,黄 捷
(北京大学公共卫生学院全球卫生学系,北京 100191)
心血管疾病(cardiovascular disease,CVD)是一组心脏和血管疾病的统称[1]。CVD是全球第一大死亡原因,2017年全球有将近两千万人死于CVD,这个数字远高于肆虐全球的新冠肺炎[2]。全球范围内,大约80%的CVD死亡发生在中低收入国家,因此CVD研究对我国的全球卫生与健康战略具有十分重要的意义[3]。
最近十余年,基因芯片的大量应用和基因数据的大量采集催生了全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)[4],将传统流行病学带入了系统流行病学时代。GWAS方法不需要事先假设某个基因跟某个疾病有相关性,而是通过综合分析基于人群大队列的表型数据和基于高密度生物芯片检测出来的基因型数据来快速筛选潜在致病性的单核苷酸变异位点(single nucleotide variation,SNV)。早期的芯片主要检测次要等位基因频率(minor allele frequency,MAF)高于1%的SNV,这样的SNV也称为单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)。
由于CVD是全球第一大死亡原因,最近十多年来GWAS的研究很多,也发现了很多CVD相关的易感基因位点,并且对疾病的预测和预防产生了积极的影响[5]。但是传统的方法主要聚焦于临床的定义,一些听起来似乎比较简单的某种CVD(如冠心病或心肌梗死),可能有着非常复杂的临床和病生理标准。而本研究从公共卫生的角度出发,完全基于世界卫生组织(World Health Organization,WHO)颁布的国际疾病分类标准(International Classification of Diseases,ICD)对心血管疾病进行分类。目前常用的是第10次修订版本(ICD-10),该版本于1990年修订完成[6]。虽然从临床和卫生经济学的角度来说很有必要把疾病分门别类,但是ICD的分类标准是否有足够的分子生物学依据,这一点尚不很清楚。……