邢国强,运 涛,赵国刚

邢国强,运涛,赵国8刚,天津市第五中心医院普外科 天津市 300450

0 引言

在全球范围内,肝癌是恶性肿瘤相关死亡的第四大常见原因,在发病率方面排名第六位[1].我国癌症统计报告显示2015年我国居民癌症粗死亡率为169.41/10万,标化死亡率为159.01/10万,其中肝癌死亡率居于第2位(仅次于肺癌)[2].随着手术、化疗、靶向及免疫治疗方式的进步以及多学科综合治疗方案的普及,肝癌患者生存期虽然有所延长,但防控形势依旧严峻.因此,寻找新的肝癌标志物和潜在治疗靶点,研究其在肝癌发病过程中的分子机制对于肝癌防控具有重要意义.

转录相关酸性卷曲蛋白3(transforming acidic coiled coil protein 3,TACC3)是TACC家族的重要成员,TACC3受到Aurora-A激酶的调节,靶向中心体,在有丝分裂期间对微管生长至关重要[3].有研究表明,TACC3基因在乳腺癌[4],非小细胞肺癌[5],胃癌[6]中高表达,并与预后较差有关.目前关于TACC3基因在肝癌中的表达情况及其与患者预后的关系鲜见报道.本研究旨在通过生物信息学探讨TACC3基因在肝癌中的表达水平及其与患者预后的关系.

1 材料和方法

1.1 材料 检索BioGPS[7]、Oncomine[8]、癌症细胞系百科全书(cancer cell line encyclopedia,CCLE)等数据库,获取TACC3基因在肝癌中的表达数据.应用Kaplan-Meier Plotter[9]、GEPIA[10]数据库分析TACC3基因对肝癌患者预后生存的影响.

1.2 方法

1.2.1 利用BioGPS数据库分析:TACC3基因在人体正常组织中的表达情况,在BioGPS数据库检索框中输入“TACC3”进行检索,物种选择Human.

1.2.2 在Oncomine数据库主界面设定检索条件:(1)Cancer Type:Liver Cancer;(2)Gene:TACC3;(3)Data Type:mRNA;(4)Analysis Type:CancervsNormal analysis;(5)临界值限定:P＜0.05,Fold Change=all,Gene Rank=all DNA type=mRNA.

1.2.3 在CCLE数据库检索框中输入“TACC3”进行检索:对TACC3基因在各细胞系中的表达进行……