葛宝柱，徐 强，陈赢男

(南京林业大学，南方现代林业协同创新中心，林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室， 江苏 南京 210037)

聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)能在体外大量扩增微量的DNA，已成为使用最广泛的分子生物学实验技术，在生物学科各个领域和分支都有广泛的应用。利用PCR扩增目标基因开展测序，可以为基因特征和群体遗传动态研究，以及深入了解物种系统发育史提供有价值的分子信息。然而这些应用都是建立在PCR能够准确复制模板序列的基础之上，但PCR介导的重组(PCR-mediated recombination)现象有可能导致嵌合产物的形成，从而影响序列信息的准确性。

PCR介导的重组是指在PCR反应过程中同源序列的扩增片段发生重组，从而在离体条件下产生嵌合产物(chimeric products)或重组分子(recombinant molecules)的现象[1]。在环境微生物群落多样性分析中，由于嵌合产物的形成，会导致生物多样性的估计偏高[2]。在分子进化研究中，嵌合产物的存在也会影响对基因进化的解释[3]。PCR介导的重组也被认为是单分子测序技术产生误差的重要因素之一[4]。因此，在研究中需要警惕PCR介导的重组现象，注意区分扩增产物中的重组分子与真正的原始单倍型序列。但另一方面，对于体外分子进化研究来说，PCR介导的重组可以开发成为能持续提供新基因的潜在工具，这些新基因可以有效地在分子定向进化中加以应用[5]。

前人研究表明，在利用PCR扩增多基因家族或杂合度较高的单基因时，由于反应体系中存在相似度较高的模板序列，比较容易出现PCR介导的重组，产生嵌合产物[6]。……