陈雨,邓九州,吴晓宇,赵玉梅,王洁,段巧红,黄家保

白菜基因家族的鉴定与表达分析

陈雨,邓九州*,吴晓宇,赵玉梅,王洁,段巧红,黄家保**

山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室, 山东 泰安 271018

基因在开花调控、根系生长、光形态建成、种子萌发、果实发育、逆境胁迫等生物学过程中发挥重要作用，但在白菜中还未有关于基因的报道。本研究通过生物信息学方法鉴定到18个白菜基因，其蛋白分子量为11285.63~35796.93D，理论等电点介于4.66~9.35之间，外显子数量为2~5个；大多数成员N端都含有保守结构域B-box1和B-box2，精氨酸和亮氨酸是在所有成员中都保守的氨基酸残基；该家族基因不均匀分布于白菜10条染色体上，多数基因出现基因复制，产生2个以上同源基因；多数基因与拟南芥基因具有线性对应关系。顺式作用元件分析表明白菜基因启动子上含有大量的光、厌氧、激素、低温等响应元件。组织特异性表达分析发现多数基因在不同组织中的表达水平与根类似；在花中的表达水平显著高于其它成员。此外，绝大多数白菜基因对盐胁迫有不同程度的响应。这些结果为后续解析基因在白菜中的生物学功能奠定了基础。

白菜; DBB; 生物信息学分析

锌指蛋白是真核生物中的一类具有锌指结构域的转录因子家族[1]，其中含有B-box基序的蛋白称为BBX，在拟南芥中有32个成员，其C端通常含有CCT结构域[2]。含有CCT结构域的蛋白通常与光周期有关，在植物中与成花相关基因一起调控开花时间[3]。……