基于RNA-seq的福建柏R2R3-MYB转录因子鉴定和分析
2021-05-26周成城谢德金杨德明何天友陈凌艳郑郁善
周成城, 谢德金, 杨德明, 何天友, 陈凌艳, 郑郁善,
(1.福建农林大学园林学院;2.福建农林大学林学院, 福建 福州 350002)
转录因子(transcription factors, TFs)又称为反式作用因子,是一类能够与DNA序列上的启动子区域直接或间接地发生特异性作用的蛋白,从而激活或抑制目标基因的转录[1].转录因子家族参与植物生长发育、代谢等各个方面的基因表达调控,具有重要的生物学意义[2].MYB转录因子是植物中最早被克隆到的[3],也是真核生物中功能最多样的家族[4].根据DNA结合结构域数目的不同,MYB转录因子分为1R-MYB、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB,其中R2R3-MYB是植物MYB转录因子家族中数量最多的一类[5].R2R3-MYB的主要功能是初级和次级代谢物的调节、植物生长发育调节、生物或非生物胁迫响应等[6].如拟南芥AtMYB83和AtMYB46是AtSND1的直接靶点,可诱导触发AtMYB58、AtMYB63和AtMYB85的表达,这些基因又通过与相关启动子AC元件相互作用来上调各种木质素合成基因[7-8];R2R3-MYB的S7、S6和S2亚家族分别对黄酮醇[9]、花青素及原花青素[10]调控;在月季中,RhMYB108转录因子作为乙烯和茉莉酸信号接收器,通过激活和增强衰老相关基因表达从而调节花瓣衰老的启动的模式[11];拟南芥AtMYB49通过调节角质层形成和抗氧化防御调节拟南芥的耐盐性[12].R2R3-MYB除了正调节作用,还可以作为负调控因子行使功能.在拟南芥中,AtMYB4能够抑制C4H的转录,从而抑制芥子酸酯的合成[13].以上研究均表明R2R3-MYB转录因子对植物的生长发育、物质合成等具有重要的作用.
福建柏[Fokieniahodginsii(Dunn) Henry et Thomas]为柏科福建柏属,为我国特有种属,分布在福建、广东、云南、广西等省区[14].其树干通……