肾透明细胞癌舒尼替尼耐药的分子标志物筛选及相关生物学功能分析*
2021-05-19刘郴郴宋正帅章小平
华中科技大学学报(医学版) 2021年2期
刘郴郴, 宋正帅, 章小平
华中科技大学同济医学院附属协和医院 1泌尿外科 2泌尿外科研究所,武汉 4300223 华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院泌尿外科,武汉 430014
肾癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一,其中又以肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)占大多数(75%)[1-2]。约30%的肾癌患者在初诊时发现转移病灶以及30%的患者在行根治性肾切除术后发现复发是造成患者不良预后的主要原因[3-4]。目前针对进展期肾癌,随机临床试验证实靶向血管内皮生长因子(VEGF)等通路的抗血管生成药物,包括舒尼替尼、帕唑帕尼等,能够有效缓解疾病进展,并已得到广泛应用[5]。然而,目前仍缺乏能有效预测ccRCC靶向药物耐药性的分子标记物,因此,寻找和确认相应的分子标记物以预测疗效,探索耐药机制,是精准治疗的关键[1]。近年来,随着高通量芯片和生物信息学技术的发展,我们可以获取和分析肿瘤、肿瘤毗邻组织和正常组织在多种基因表达水平上的差异,从而发现肿瘤发展、侵袭、转移、复发以及靶向药物耐药等表型中的潜在分子机制。本研究基于TCGA、GEO等公共数据库,利用在线生物信息学工具和软件对数据进行筛选、分析、整理,得到ccRCC对舒尼替尼获得性耐药的分子标志物,为患者预后判断及治疗选择提供依据,并对其中潜在的信号通路及分子机制进行了探讨,为后续通过实验及临床数据进行进一步验证奠定了基础。
1 材料和方法
1.1 微阵列数据
从GEO数据库中下载基因表达谱GSE76068。根据安捷……
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