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甲状腺乳头状癌预后标志物的研究

2021-05-13罗锦琳张超杰邹联洪范培芝

湖南师范大学学报(医学版) 2021年2期
关键词:差异分析

陈 帅,罗锦琳,罗 霁,张超杰,邹联洪,3,范培芝

(1.湖南师范大学第一附属医院/湖南省人民医院,长沙 410002;2.湘雅常德医院,常德 415003;3.急危重症代谢组学湖南省重点实验室,长沙 410002)

甲状腺癌是内分泌器官最常见的恶性肿瘤,其发病率在过去三十年间增加了三倍多[1][2],虽然甲状腺乳头状癌(thyroid papillary carcinoma,PTC)患者可获得良好的预后[3],但仍有一部分的甲状腺乳头状癌的患者会发生复发和远处转移[4]。目前有许多关于疾病的生物信息学研究,但有关PTC 的生物信息学研究却不多见,固在本研究中,我们期望通过生信的方法来初步探索PTC 在分子水平的机制研究。

1 资料与方法

临床资料:在2016 年9 月~2018 年9 月就诊于湖南省人民医院诊断为PTC 的患者中随机选取3 位患者,在术中收集PTC 患者的甲状腺乳头状癌组织及相对应的癌旁组织标本(距肿瘤大于2cm),我们将其收取的标本用于转录组芯片的相关研究。本研究收集相关标本均得到湖南省人民医院伦理委员会的批准同意,患者或其法定监护人对本次研究方法及内容均知情同意,并签字认可。所有的患者病理和临床相关资料均齐全。

表1 甲状腺乳头状癌患者一般临床资料

1.1 转录组芯片检测 用Trizol 试剂组织RNA 试剂盒分别从冷冻组织中提取总RNA。采用基因芯片技术对基因化学进行LncRNA、mRNA 分析。简单地说,将rRNA 去除后,制备生物素化Arna(CrNA)。得到原始视图人类基因表达阵列(CAT)。再进行杂交和扫描。所有样品均经技术复制件处理。基因芯片扫描仪GeneChip Scanner 3000 7G 用于扫描完成的阵列。图像用基因芯片命令控制台(AGACC)提取,用表达式控制台软件进行分析。……

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