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基于GBS技术的233份大蒜种质资源群体进化分析

2021-05-13管梦娇谢亚楠顾启玉孙秀东高荣广

山东农业科学 2021年4期
关键词:高质量分析

管梦娇,谢亚楠,顾启玉,孙秀东,高荣广

(山东农业大学园艺科学与工程学院,山东 泰安 271018)

大蒜(Allium sativum L.)为百合科(Liliacaea)葱属(Allium)两年生草本植物,其幼苗(蒜苗)、花茎(蒜薹)和鳞茎(蒜头)甚至青蒜和蒜黄都能作为蔬菜来食用,又因为大蒜拥有独特的香气,也是人们日常生活所必备的重要香辛料之一[1]。大蒜富含大蒜素、蛋白质、糖类、抗坏血酸和多种还原性硫化物等物质,具有非常高的烹饪价值、功能性价值和医学价值[2,3]。大蒜原产自西亚地区的高原地带,在中国已有2 000多年的种植历史,我国已成为世界上大蒜种植面积和产量最多的国家。

大蒜是我国传统的出口创汇蔬菜产品,属于我国的名特蔬菜种类。由于我国大蒜种质资源保护工作起步晚、收集保存资源不足、遗传多样性及亲缘关系缺乏系统研究,再加上环境和气候变化使大蒜不断发生变异及各地间频繁引种,导致大蒜种质名称混乱,种系不清,同名异物或异名同物的情况非常严重。因此,亟需对我国大蒜种质的遗传进化特性进行鉴定,构建种质资源库,为探索种质创新方法、研究配套关键技术以促进大蒜的丰产丰收奠定基础。

简化基因组测序(GBS)技术是指通过测序进行基因分型,是通过选取合适的限制性内切酶结合高通量群体测序来构建SNP分子标记的方法,可应用于超高密度遗传图谱构建[4,5]、群体GWAS分析[6,7]、群体遗传分析[8]等领域。GBS避免了传统方法的一些不足,虽不能达到覆盖全基因组深度的程度,但由于其省时、价廉、有效等优点而得到大家的青睐[9]。……

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