梁月秀，郭志强，冯凡，张春来

（山西农业大学 农学院，山西 太谷030801）

高粱（Sorghum bicolor）属单子叶植物纲，是二倍体（2n=20）禾本科高粱属作物。高粱原产于热带，抗逆性强［1］，是节水减肥的理想作物且具有一定的药用和经济价值，因此越来越受到重视。

热激转录因子（Heat shock transcription factor，Hsf）是植物热激反应中重要的调控因子［2］，具有5 个功能结构域，分别是N 端的DNA 结合域、C端的转录激活结构域、核定位、核输出信号及寡聚化结构域［3，4］，能够响应植物的逆境胁迫。目前多种植物的Hsf基因已被鉴定和分析，如在拟南芥、水稻、谷子、番茄、杨树和玉米等植物中分别鉴定出21、25、27、18、28 和25 个Hsf基因［5～7］。高粱全基因组测序于2009 年完成，林勇翔等［8］基于全基因组水平对豆科及禾本科植物的Hsf 家族进行了比较基因组学分析，但其研究的侧重点在于不同物种间的比较，并未对高粱这一物种的Hsf 转录因子进行系统研究。本研究对高粱Hsf基因进行一系列的生物信息学分析，并通过17 份转录组数据筛选出与高粱耐热相关的Hsf基因，为高粱抗逆育种奠定理论基础。

1 材料与方法

1.1 高粱Hsf 基因鉴定及理化性质分析

利用PlantTFDB 数据库［9］（http：//planttfdb.gao-lab.org/）获取高粱Hsf 转录因子，去除重复序列最终得到高粱Hsf 转录因子家族成员，将其蛋白质序列提交至Pfam 数据库进行结构域验证。基于NCBI 数据库模式植物的已有基因名对高粱Hsf 家族进行命名。利用在线网站ExPASy-Compute pI/Mw（http：//web.expasy.org/compute_pi/）计算高粱Hsf 蛋白质的分子量和理论等电点。

1.2 高粱Hsf 基因二级结构、信号肽预测与亚细胞定位

利 用SOPMA（https：//npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl？page=npsa_sopma.html）、SignalP-5.0 Server（www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/）和ProtComp 9.0（http：//linux1.softberry.com/berry.phtml？ topic=protcomppl&group=programs&subgroup=proloc）对Hsf 蛋白质二级结构、信号肽及亚细胞定位进行预测分析。……